More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3127 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  54.28 
 
 
763 aa  728    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  64.37 
 
 
750 aa  962    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  90.62 
 
 
754 aa  1359    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  91.03 
 
 
754 aa  1361    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  91.03 
 
 
754 aa  1362    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  90.62 
 
 
754 aa  1358    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  90.62 
 
 
754 aa  1356    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  90.62 
 
 
754 aa  1358    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  89.39 
 
 
754 aa  1361    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.17 
 
 
759 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  90.76 
 
 
754 aa  1360    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  91.03 
 
 
754 aa  1362    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.17 
 
 
759 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  63.82 
 
 
750 aa  927    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
752 aa  1506    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  88.93 
 
 
755 aa  1338    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  37.82 
 
 
735 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.1 
 
 
761 aa  325  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.26 
 
 
856 aa  323  9.000000000000001e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.11 
 
 
759 aa  320  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.33 
 
 
762 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  31.76 
 
 
740 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.89 
 
 
759 aa  310  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.28 
 
 
848 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.12 
 
 
849 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.02 
 
 
785 aa  308  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.02 
 
 
785 aa  307  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.47 
 
 
839 aa  305  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  31.06 
 
 
989 aa  303  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  30.99 
 
 
849 aa  297  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.73 
 
 
845 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  32.15 
 
 
748 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.27 
 
 
844 aa  292  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.89 
 
 
856 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.31 
 
 
853 aa  291  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.52 
 
 
991 aa  282  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.97 
 
 
834 aa  279  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.75 
 
 
995 aa  279  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  32.04 
 
 
1029 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.67 
 
 
756 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.43 
 
 
990 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.97 
 
 
844 aa  274  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.38 
 
 
991 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.4 
 
 
1055 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.59 
 
 
846 aa  270  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  30.14 
 
 
734 aa  269  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.3 
 
 
844 aa  267  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  32.26 
 
 
1001 aa  265  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.55 
 
 
996 aa  264  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.17 
 
 
981 aa  263  8e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  38.89 
 
 
433 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  27.48 
 
 
977 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.64 
 
 
855 aa  252  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.4 
 
 
846 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.06 
 
 
995 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  27.86 
 
 
843 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  31.63 
 
 
900 aa  245  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  38.24 
 
 
403 aa  243  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  35.98 
 
 
419 aa  238  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  35.98 
 
 
419 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  35.84 
 
 
461 aa  231  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.42 
 
 
911 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  28.77 
 
 
885 aa  228  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.24 
 
 
753 aa  224  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 
416 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 
470 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 
470 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  32.15 
 
 
471 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.19 
 
 
406 aa  223  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  36.28 
 
 
423 aa  223  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  36.46 
 
 
413 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  36.91 
 
 
411 aa  220  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  34.26 
 
 
464 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  35.91 
 
 
410 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  36.9 
 
 
411 aa  219  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  33.95 
 
 
461 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  33.67 
 
 
399 aa  214  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  33.87 
 
 
470 aa  214  7e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.94 
 
 
1400 aa  211  3e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  27.01 
 
 
793 aa  211  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  33.57 
 
 
415 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.03 
 
 
474 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  33.42 
 
 
403 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.72 
 
 
858 aa  203  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  42.76 
 
 
291 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  33.87 
 
 
533 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.93 
 
 
532 aa  201  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  34.31 
 
 
533 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  35.55 
 
 
533 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  34.47 
 
 
533 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  38.93 
 
 
308 aa  197  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  30.84 
 
 
474 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  37.85 
 
 
280 aa  195  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  33.49 
 
 
464 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  33.18 
 
 
533 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 
534 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  28.97 
 
 
495 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  32.82 
 
 
532 aa  191  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  29.32 
 
 
468 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  34.02 
 
 
449 aa  191  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>