More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3115 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 412 aa  842    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  60.68 
 
 		 408 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  60.44 
 
 		 408 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  46.44 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 409 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 409 aa  342  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  44.2 
 
 		 409 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  58.01 
 
 		 185 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2109  transcriptional regulator, AraC family  35.12 
 
 		 209 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1572  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  27.82 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.72 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 719 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1455  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  28.65 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 535 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.13 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  30.53 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  40.86 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  34.04 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 773 aa  77  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  21.38 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 531 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  33.02 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  39.78 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.14 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 525 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.37 
 
 		 325 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 1201 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 287 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 202 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 250 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.02 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  29.41 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.08 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.66 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1507  AraC family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  27.2 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  26.45 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  33.04 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  31.36 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  33.65 
 
 		 303 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.68 
 
 		 316 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>