More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3068 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  447  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  90.74 
 
 
216 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  90.28 
 
 
216 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  90.28 
 
 
216 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  90.74 
 
 
216 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  90.28 
 
 
216 aa  411  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  90.28 
 
 
216 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  90.74 
 
 
216 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  90.28 
 
 
216 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  89.81 
 
 
216 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  90.74 
 
 
216 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  48.96 
 
 
277 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  45.31 
 
 
239 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  49.45 
 
 
261 aa  195  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  47.89 
 
 
274 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  46.35 
 
 
313 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  44.86 
 
 
250 aa  191  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  43.28 
 
 
271 aa  188  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  43.08 
 
 
247 aa  187  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  42.02 
 
 
223 aa  185  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  44.75 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  46.99 
 
 
249 aa  177  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  41.33 
 
 
256 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  42.5 
 
 
217 aa  171  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  40.3 
 
 
212 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  42.35 
 
 
208 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  39.8 
 
 
210 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  40.31 
 
 
290 aa  165  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  40.21 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  44.33 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  41.54 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  41.33 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  41.33 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  38.89 
 
 
212 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  39.18 
 
 
212 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  39.29 
 
 
212 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  39.22 
 
 
211 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  39.22 
 
 
211 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  39.32 
 
 
224 aa  155  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  38.38 
 
 
215 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  38.38 
 
 
212 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  36.84 
 
 
247 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  40.21 
 
 
223 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  39.57 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  40.8 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  40.21 
 
 
246 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  39.04 
 
 
230 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  39.04 
 
 
230 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  39.22 
 
 
211 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  39.47 
 
 
269 aa  148  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  36.51 
 
 
233 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  39.89 
 
 
208 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  35.45 
 
 
191 aa  128  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  41.07 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  33.86 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  33.57 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  32.14 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.35 
 
 
743 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.147032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3196  RelA/SpoT family protein  32.35 
 
 
743 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0189864  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1894  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 
753 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818102  hitchhiker  0.00061937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3392  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.59 
 
 
743 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  35.42 
 
 
388 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  27.06 
 
 
356 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0946  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.17 
 
 
745 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  28.02 
 
 
362 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  37.14 
 
 
705 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  37.14 
 
 
705 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  29.3 
 
 
750 aa  62  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  26.47 
 
 
356 aa  62  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2255  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.43 
 
 
769 aa  62  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.3559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.19 
 
 
705 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_004310  BR0652  RelA/SpoT family protein  29.94 
 
 
750 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0645  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  29.94 
 
 
750 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1856  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.35 
 
 
715 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.709628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0033  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.15 
 
 
737 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0805282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0617  ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3' pyrophosphohydrolase  32.77 
 
 
729 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1922  RelA/SpoT protein  31.93 
 
 
774 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.604164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2635  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.93 
 
 
761 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4687  GTP pyrophosphokinase  29.89 
 
 
729 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167199 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0468  GTP pyrophosphokinase  31.75 
 
 
742 aa  60.1  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.135158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  27.47 
 
 
365 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0031  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.43 
 
 
733 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.514737  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.19 
 
 
736 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  27.17 
 
 
359 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  24.68 
 
 
362 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2445  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 
737 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2113  GTP diphosphokinase  32.47 
 
 
770 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.978919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.85 
 
 
716 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  28.09 
 
 
359 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4115  GTP pyrophosphokinase  28.48 
 
 
737 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2647  RelA/SpoT family protein  30.72 
 
 
762 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0342541  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2636  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.37 
 
 
748 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3877  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.54 
 
 
742 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2968  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.72 
 
 
760 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>