More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3065 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  98.31 
 
 
265 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  98.73 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  98.73 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  98.73 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  98.73 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  98.73 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  98.73 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  98.73 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  98.73 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  79.65 
 
 
236 aa  384  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  78.35 
 
 
245 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  97.2 
 
 
149 aa  289  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  64.59 
 
 
226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  62.39 
 
 
234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  59.01 
 
 
239 aa  272  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  59.56 
 
 
244 aa  268  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  58.48 
 
 
256 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 
249 aa  254  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  55.56 
 
 
231 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  56.64 
 
 
236 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  55.76 
 
 
232 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  56.16 
 
 
233 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  55.71 
 
 
233 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  52.38 
 
 
219 aa  211  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  53.12 
 
 
207 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  48.1 
 
 
249 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  52.45 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  47.32 
 
 
245 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 
239 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  47.03 
 
 
239 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  50.48 
 
 
243 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  47.66 
 
 
241 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  45.33 
 
 
235 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  45.33 
 
 
235 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  46.73 
 
 
241 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  48.51 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  98.99 
 
 
100 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  47.03 
 
 
239 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  44.84 
 
 
240 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  42.42 
 
 
244 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  47.57 
 
 
243 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  44 
 
 
239 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  47.95 
 
 
249 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  45.63 
 
 
242 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  46.89 
 
 
246 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  42.15 
 
 
241 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  48.34 
 
 
244 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 
232 aa  174  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  65.18 
 
 
114 aa  161  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  66.67 
 
 
118 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  59.09 
 
 
126 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  61.06 
 
 
118 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  54.63 
 
 
113 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  29.74 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  32.38 
 
 
256 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  36.1 
 
 
261 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.33 
 
 
245 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.65 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  30.28 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  30.8 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  33.19 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  31.09 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  29.5 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  30.36 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
289 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
289 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
289 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
289 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  33.61 
 
 
260 aa  95.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.31 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.74 
 
 
292 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  31.3 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  29.27 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.96 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  29.37 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  30.43 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  33.77 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  32.05 
 
 
259 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1436  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  27.34 
 
 
344 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  32.05 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  31.33 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.33 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0937  RNA polymerase sigma-70 factor family protein  28.24 
 
 
286 aa  92  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  31.05 
 
 
272 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0478  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  32.17 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>