More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3020 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  90.97 
 
 
598 aa  1120    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  91.2 
 
 
571 aa  1065    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  90.97 
 
 
598 aa  1122    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  90.8 
 
 
598 aa  1118    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  91.14 
 
 
598 aa  1123    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  100 
 
 
598 aa  1239    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  91.14 
 
 
598 aa  1122    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  91.14 
 
 
598 aa  1123    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  90.97 
 
 
598 aa  1122    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  91 
 
 
600 aa  1112    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  91.14 
 
 
598 aa  1123    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  52.61 
 
 
601 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  50.09 
 
 
598 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.83 
 
 
601 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  35.79 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.55 
 
 
605 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.55 
 
 
605 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  38.14 
 
 
621 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.1 
 
 
604 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  37.08 
 
 
626 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  39.86 
 
 
604 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  35.55 
 
 
600 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  36.32 
 
 
606 aa  348  1e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.82 
 
 
599 aa  346  6e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.06 
 
 
599 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.17 
 
 
619 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.19 
 
 
614 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.88 
 
 
613 aa  337  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.37 
 
 
605 aa  333  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  39.28 
 
 
632 aa  332  8e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  41.2 
 
 
595 aa  327  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.51 
 
 
595 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  33.33 
 
 
599 aa  326  9e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  40.72 
 
 
595 aa  323  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.1 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  38.48 
 
 
604 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.21 
 
 
636 aa  319  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.68 
 
 
613 aa  316  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.12 
 
 
582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  34.22 
 
 
653 aa  313  6.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  38.01 
 
 
674 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  40.33 
 
 
630 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.44 
 
 
587 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.63 
 
 
583 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.26 
 
 
662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  36.6 
 
 
703 aa  306  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  38.95 
 
 
578 aa  306  8.000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  38.8 
 
 
593 aa  306  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  42.31 
 
 
651 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.38 
 
 
614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  37.79 
 
 
633 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  41.76 
 
 
652 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.6 
 
 
655 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  42.86 
 
 
638 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.27 
 
 
663 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.27 
 
 
664 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  40.96 
 
 
574 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  35.04 
 
 
585 aa  299  8e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  40.69 
 
 
574 aa  299  8e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.65 
 
 
588 aa  299  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  41.32 
 
 
660 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.05 
 
 
660 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  41.05 
 
 
660 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  40.69 
 
 
574 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  40.69 
 
 
574 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.45 
 
 
617 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  32.74 
 
 
595 aa  297  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  40.16 
 
 
574 aa  297  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  40.16 
 
 
574 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  40.16 
 
 
574 aa  297  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  41.71 
 
 
601 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  40.69 
 
 
574 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  35.52 
 
 
704 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.32 
 
 
587 aa  296  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  34.07 
 
 
632 aa  296  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.05 
 
 
660 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  36.42 
 
 
586 aa  296  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  40.77 
 
 
663 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  35.94 
 
 
576 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.58 
 
 
544 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  39.89 
 
 
574 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  36.7 
 
 
660 aa  294  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  35.65 
 
 
564 aa  294  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.79 
 
 
611 aa  294  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  34.52 
 
 
577 aa  293  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.23 
 
 
640 aa  293  6e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  37.69 
 
 
573 aa  293  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  38.48 
 
 
602 aa  292  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  37.06 
 
 
575 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  34.52 
 
 
586 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  40.16 
 
 
584 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  39.85 
 
 
588 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  36.6 
 
 
603 aa  291  3e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  31.71 
 
 
582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  34.67 
 
 
652 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  31.71 
 
 
582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  31.71 
 
 
582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.29 
 
 
588 aa  290  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  39.39 
 
 
576 aa  289  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  37.2 
 
 
574 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>