177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3012 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  100 
 
 
298 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  94.3 
 
 
298 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  93.62 
 
 
298 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  93.96 
 
 
298 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  93.96 
 
 
298 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  93.62 
 
 
298 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  93.62 
 
 
298 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  94.3 
 
 
298 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  93.62 
 
 
298 aa  552  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  93.29 
 
 
298 aa  551  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  81.02 
 
 
299 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  81.36 
 
 
298 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  92 
 
 
250 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  73.56 
 
 
296 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  73.56 
 
 
296 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  72.54 
 
 
296 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  62.08 
 
 
300 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  50.18 
 
 
282 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  47.93 
 
 
293 aa  257  2e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  45.86 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  46.13 
 
 
280 aa  246  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  45.07 
 
 
277 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  42.61 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  47.18 
 
 
260 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  44.87 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  44.27 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  41.67 
 
 
277 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  40.84 
 
 
277 aa  202  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  39.37 
 
 
283 aa  192  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  38.75 
 
 
276 aa  191  1e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  37.59 
 
 
282 aa  188  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  40.23 
 
 
285 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  40.98 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  39.47 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  36.84 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  35.87 
 
 
281 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  35.66 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  36.53 
 
 
296 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  35.71 
 
 
283 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  34.6 
 
 
283 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  35.45 
 
 
287 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  35.61 
 
 
293 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  36.36 
 
 
287 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  35.61 
 
 
289 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  37.08 
 
 
290 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  34.69 
 
 
287 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  35.23 
 
 
283 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  35.61 
 
 
293 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  35.23 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  35.23 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  37.08 
 
 
297 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  34.67 
 
 
282 aa  162  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  34.84 
 
 
283 aa  162  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  31.75 
 
 
291 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  35.71 
 
 
286 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  34.67 
 
 
281 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  35.85 
 
 
279 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  34.34 
 
 
289 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  34.46 
 
 
280 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  34.47 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  34.6 
 
 
281 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  34.83 
 
 
284 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  34.08 
 
 
279 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  34.6 
 
 
289 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  34.59 
 
 
282 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  33.08 
 
 
379 aa  149  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  34.33 
 
 
286 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  33.71 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  34.73 
 
 
282 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  34.6 
 
 
283 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  34.83 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  34.57 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  34.34 
 
 
286 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  34.57 
 
 
285 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  33.83 
 
 
283 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  34.59 
 
 
285 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  33.8 
 
 
295 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  31.2 
 
 
544 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  33.46 
 
 
285 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  35.74 
 
 
294 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  34.57 
 
 
285 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  31.97 
 
 
282 aa  142  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  33.46 
 
 
285 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  34.2 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  32.58 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  34.72 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  33.46 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  33.46 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  33.46 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  30.43 
 
 
326 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  33.83 
 
 
285 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  33.08 
 
 
285 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  34.98 
 
 
295 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  33.08 
 
 
285 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  33.7 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  33.08 
 
 
285 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  34.69 
 
 
289 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  33.08 
 
 
285 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  32.46 
 
 
281 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>