195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2772 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  97.95 
 
 
146 aa  293  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  97.95 
 
 
146 aa  293  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  97.26 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  97.26 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  97.26 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  97.26 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  97.26 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  97.26 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  97.26 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  97.26 
 
 
146 aa  293  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  78.77 
 
 
146 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  76.03 
 
 
146 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  60.14 
 
 
140 aa  173  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  60.14 
 
 
140 aa  173  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  51.39 
 
 
149 aa  159  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  57.45 
 
 
146 aa  158  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  55.8 
 
 
141 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  54.29 
 
 
143 aa  150  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  53.96 
 
 
157 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.88 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  48.23 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  42.45 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
154 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.25 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  41.73 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.84 
 
 
146 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.54 
 
 
148 aa  110  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  38.3 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.44 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  31.39 
 
 
162 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  28.38 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  28.38 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  25.17 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 
250 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
290 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  30.16 
 
 
1074 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  25.71 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  25.71 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  25.71 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  25.53 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  25.53 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  25.53 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
144 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  25.53 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  25.53 
 
 
160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 
286 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
269 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1964  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
427 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4414  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
506 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  26.43 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  24.82 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  26.71 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2235  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
865 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
1226 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  28.89 
 
 
851 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.49 
 
 
543 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
781 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
1385 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
460 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
139 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0476  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
134 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3799  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 
140 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000337486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01455  sensor histidine kinase  32.32 
 
 
436 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
762 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
1361 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0072  serine-protein kinase  28.57 
 
 
169 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1673  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
1390 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1770  histidine kinase  33.05 
 
 
778 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
1390 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  28.03 
 
 
828 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
1390 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3249  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
546 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.632077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.93 
 
 
249 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
408 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2270  ATPase domain-containing protein  29.7 
 
 
471 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.250434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  30.3 
 
 
473 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
325 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2545  histidine kinase  29.7 
 
 
471 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.13 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
632 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2113  ATPase domain-containing protein  32.1 
 
 
757 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275639  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
779 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85917  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1722  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  32.29 
 
 
118 aa  43.9  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0271292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3250  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
488 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  36 
 
 
557 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
632 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
803 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>