More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2463 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  100 
 
 
118 aa  235  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  99.15 
 
 
118 aa  234  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.32995e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  98.31 
 
 
118 aa  232  2e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  97.46 
 
 
118 aa  231  2e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  97.46 
 
 
118 aa  231  2e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  97.46 
 
 
118 aa  230  4e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.6841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  98.31 
 
 
118 aa  231  4e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  98.31 
 
 
118 aa  231  4e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  95.76 
 
 
118 aa  228  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  95.76 
 
 
118 aa  228  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  95.76 
 
 
118 aa  228  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  79.28 
 
 
126 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.26248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  74.34 
 
 
127 aa  173  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  54.87 
 
 
116 aa  140  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  54.87 
 
 
130 aa  140  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  54.87 
 
 
116 aa  140  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  53.21 
 
 
131 aa  127  7e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.45103e-05  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  55.66 
 
 
118 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  49.57 
 
 
125 aa  123  8e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 
119 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.52845e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  52.34 
 
 
122 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  49.56 
 
 
120 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  46.96 
 
 
119 aa  119  1e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 
119 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 
121 aa  115  1e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  47.27 
 
 
118 aa  115  2e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  48.67 
 
 
123 aa  114  4e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  47.79 
 
 
118 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  46.36 
 
 
121 aa  112  2e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  52.73 
 
 
119 aa  112  2e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  46.36 
 
 
119 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  43.52 
 
 
122 aa  111  4e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 
119 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  50.46 
 
 
122 aa  110  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.70949e-12  hitchhiker  1.54001e-07 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  46.9 
 
 
139 aa  109  1e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  46.9 
 
 
138 aa  109  1e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  49.04 
 
 
156 aa  109  1e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  46.02 
 
 
138 aa  108  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 
117 aa  108  2e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  48.65 
 
 
132 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.64371e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  50.46 
 
 
133 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  41.53 
 
 
122 aa  107  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  48.15 
 
 
131 aa  107  7e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 
117 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 
119 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  46.49 
 
 
127 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 
123 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 
143 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  44.95 
 
 
121 aa  103  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 
132 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  45.19 
 
 
129 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  46.36 
 
 
116 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  46.36 
 
 
116 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  49.45 
 
 
144 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 
126 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  44.86 
 
 
122 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  44.55 
 
 
136 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 
137 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 
128 aa  100  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  43.97 
 
 
122 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  42.45 
 
 
159 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  43.4 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  39.42 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 
131 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 
141 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4215  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  41.51 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  47.25 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  44.14 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  43.24 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  42.2 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 
137 aa  94.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 
171 aa  94.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  39.62 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 
137 aa  94  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  46.15 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  40 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  38.68 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  43.27 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  41.12 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 
130 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  44.23 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>