176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2024 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 
741 aa  1522    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  47.74 
 
 
726 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  35.11 
 
 
744 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  34.78 
 
 
729 aa  346  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  34.35 
 
 
764 aa  336  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  33.38 
 
 
775 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  32.42 
 
 
736 aa  309  9e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  31.87 
 
 
763 aa  244  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  28.8 
 
 
741 aa  204  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  28.7 
 
 
917 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  29.11 
 
 
750 aa  190  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  28.03 
 
 
750 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
729 aa  178  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  28.38 
 
 
762 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  27.67 
 
 
795 aa  167  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  26.78 
 
 
781 aa  162  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  27.38 
 
 
783 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  31.29 
 
 
737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  26.2 
 
 
804 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  25.79 
 
 
779 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 
1027 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  22.48 
 
 
811 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  25.85 
 
 
791 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  24.46 
 
 
801 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  28.72 
 
 
778 aa  108  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  27.56 
 
 
899 aa  107  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  26.79 
 
 
905 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  24.42 
 
 
887 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.9 
 
 
970 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  27.55 
 
 
948 aa  101  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  23.39 
 
 
944 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  26.2 
 
 
921 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.81 
 
 
799 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  24.7 
 
 
901 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  24.66 
 
 
854 aa  94  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  25.14 
 
 
850 aa  94  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.63 
 
 
885 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  25.96 
 
 
566 aa  93.2  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  23.52 
 
 
860 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  28.41 
 
 
823 aa  92.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.73 
 
 
1540 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.75 
 
 
733 aa  91.3  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  26.03 
 
 
912 aa  90.9  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  26.36 
 
 
701 aa  90.9  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  23.45 
 
 
871 aa  90.9  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  24.08 
 
 
883 aa  90.5  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  24.66 
 
 
897 aa  89.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  25.89 
 
 
892 aa  89.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  28.07 
 
 
800 aa  88.2  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  23.08 
 
 
832 aa  87.8  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  24.37 
 
 
721 aa  87.4  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  23.9 
 
 
929 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  21.52 
 
 
965 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  27.06 
 
 
922 aa  86.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  23.49 
 
 
651 aa  84.3  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  26.5 
 
 
888 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  26.23 
 
 
888 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  27.05 
 
 
888 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.63 
 
 
740 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  24.13 
 
 
827 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.17 
 
 
892 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.67 
 
 
876 aa  80.5  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  24.09 
 
 
968 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  23.69 
 
 
879 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.72 
 
 
837 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.38 
 
 
717 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  26.03 
 
 
804 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.3 
 
 
868 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  31.49 
 
 
836 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.13 
 
 
724 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.14 
 
 
885 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  25.34 
 
 
899 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  24.03 
 
 
897 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.95 
 
 
920 aa  76.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23 
 
 
962 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24 
 
 
776 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  24.31 
 
 
933 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  27.63 
 
 
730 aa  75.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  24.62 
 
 
739 aa  74.7  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  24.48 
 
 
919 aa  74.3  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  23.98 
 
 
908 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  26.79 
 
 
807 aa  73.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.91 
 
 
492 aa  73.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.48 
 
 
744 aa  73.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  25 
 
 
828 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.41 
 
 
906 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.9 
 
 
792 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  22.99 
 
 
859 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  26.27 
 
 
801 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  24.76 
 
 
777 aa  71.2  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.17 
 
 
897 aa  70.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  26.43 
 
 
834 aa  70.9  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  23.94 
 
 
772 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  25.12 
 
 
780 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  24.61 
 
 
778 aa  70.1  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.04 
 
 
488 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  23.68 
 
 
885 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  25.58 
 
 
822 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  24.6 
 
 
904 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 
731 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>