240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2011 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  67.22 
 
 
612 aa  854    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  70.47 
 
 
701 aa  1038    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
701 aa  1449    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  44.78 
 
 
709 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  44.35 
 
 
714 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  28.9 
 
 
705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  30.11 
 
 
741 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  27.77 
 
 
698 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  27.77 
 
 
698 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  26.68 
 
 
681 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  24.74 
 
 
651 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  24.74 
 
 
651 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  24.67 
 
 
668 aa  197  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  25.04 
 
 
688 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  26.91 
 
 
639 aa  189  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.23 
 
 
696 aa  187  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  24.76 
 
 
687 aa  184  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2983  hypothetical protein  85.15 
 
 
102 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000183001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.69 
 
 
661 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  25.55 
 
 
684 aa  170  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  25 
 
 
698 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  23.83 
 
 
652 aa  164  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  23.94 
 
 
710 aa  160  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.72 
 
 
705 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.48 
 
 
696 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  24.21 
 
 
685 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.68 
 
 
683 aa  153  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.62 
 
 
703 aa  152  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  26 
 
 
692 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.14 
 
 
712 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  23.07 
 
 
678 aa  142  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  24.86 
 
 
710 aa  142  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  24.86 
 
 
710 aa  142  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  25.04 
 
 
648 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  24.89 
 
 
642 aa  140  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  23.85 
 
 
663 aa  135  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.73 
 
 
646 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  25.73 
 
 
646 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  25.54 
 
 
643 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  25.54 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  25.54 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  25.54 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  25.82 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  25.54 
 
 
646 aa  132  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  24.68 
 
 
689 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  25.73 
 
 
646 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.26 
 
 
670 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1737  phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain-containing protein  48.92 
 
 
151 aa  128  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.108032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  25.29 
 
 
646 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  22.5 
 
 
516 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  21.98 
 
 
516 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3548  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  38.78 
 
 
147 aa  124  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  21.85 
 
 
559 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3368  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.54 
 
 
143 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.37 
 
 
641 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0380  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  40.97 
 
 
147 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0390  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  40.97 
 
 
147 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  25.95 
 
 
637 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1286  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  40.28 
 
 
151 aa  116  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  25.95 
 
 
637 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0342  phosphotransferase enzyme II, A component  36.05 
 
 
147 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000158392  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  25.95 
 
 
637 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1440  mannitol-specific cryptic phosphotransferase enzyme IIA component  36.05 
 
 
147 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000613996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1548  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.05 
 
 
147 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  25.95 
 
 
637 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  25.68 
 
 
637 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0644  putative PTS system, ascorbate-specific IIA component SgaA  39.58 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1150  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  42.14 
 
 
138 aa  112  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1483  phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain-containing protein  39.31 
 
 
160 aa  110  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.445429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0778  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  38.85 
 
 
153 aa  111  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  23.84 
 
 
517 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  23.37 
 
 
655 aa  110  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2057  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.01 
 
 
147 aa  108  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.761537  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2846  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  41.5 
 
 
147 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000475828  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.17 
 
 
636 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000771  PTS system IIA component  31.97 
 
 
147 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2750  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.17 
 
 
143 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0137272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  25.63 
 
 
656 aa  105  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3818  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.65 
 
 
154 aa  104  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4666  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.65 
 
 
154 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3798  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.65 
 
 
154 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5711  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.65 
 
 
154 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  19.26 
 
 
646 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  22.27 
 
 
680 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.78 
 
 
628 aa  101  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4803  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.41 
 
 
154 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  23.27 
 
 
685 aa  101  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4653  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.41 
 
 
154 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4746  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.41 
 
 
154 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4663  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.41 
 
 
154 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.9682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4782  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  32.41 
 
 
154 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.34657  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  24.38 
 
 
638 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  24.32 
 
 
636 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04062  L-ascorbate-specific enzyme IIA component of PTS  31.72 
 
 
154 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04024  hypothetical protein  31.72 
 
 
154 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4725  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  31.72 
 
 
154 aa  99.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4439  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  31.72 
 
 
154 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4755  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  31.72 
 
 
154 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001412  PTS system mannitol-specific IIA component  35.81 
 
 
147 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1810  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  39.02 
 
 
144 aa  98.6  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>