More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1499 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
329 aa  676    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  84.1 
 
 
333 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  83.18 
 
 
333 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
333 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
335 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  83.18 
 
 
333 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  83.49 
 
 
333 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  83.18 
 
 
333 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  82.57 
 
 
333 aa  547  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  81.65 
 
 
335 aa  544  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  83.18 
 
 
333 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  66.16 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  66.77 
 
 
338 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  65.86 
 
 
338 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  65.56 
 
 
337 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  66.46 
 
 
338 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  66.16 
 
 
337 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  65.86 
 
 
337 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  65.86 
 
 
337 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  67.18 
 
 
333 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  64.05 
 
 
337 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  66.16 
 
 
338 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  56.19 
 
 
317 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  54.91 
 
 
399 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  56.48 
 
 
388 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  56.04 
 
 
399 aa  332  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  55.73 
 
 
400 aa  331  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  55.11 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  55.11 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  55.11 
 
 
401 aa  325  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  54.8 
 
 
398 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  54.8 
 
 
398 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  54.8 
 
 
398 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  54.8 
 
 
398 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  49.26 
 
 
345 aa  315  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  48.97 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  48.97 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  51.56 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  47.94 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  47.94 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  51.25 
 
 
345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  50.94 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  50.62 
 
 
345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  50.94 
 
 
345 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.03 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  42.21 
 
 
310 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  38.98 
 
 
412 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.53 
 
 
335 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.62 
 
 
313 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  39.41 
 
 
405 aa  202  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  39.41 
 
 
405 aa  202  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.08 
 
 
383 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.24 
 
 
304 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  39.48 
 
 
377 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  39.78 
 
 
374 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  39.41 
 
 
372 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.78 
 
 
374 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.99 
 
 
302 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  38.75 
 
 
377 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  38.29 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  38.29 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  38.29 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  38.29 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  38.29 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.22 
 
 
303 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.66 
 
 
304 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.67 
 
 
304 aa  175  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.91 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.91 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.91 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.2 
 
 
299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.33 
 
 
302 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.07 
 
 
318 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  34.07 
 
 
318 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.81 
 
 
302 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  31.5 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  32.06 
 
 
374 aa  146  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 
495 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.79 
 
 
445 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.25 
 
 
319 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.35 
 
 
488 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.46 
 
 
308 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  32.48 
 
 
427 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.38 
 
 
411 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.44 
 
 
333 aa  135  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.91 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.51 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.58 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.25 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.99 
 
 
405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.1 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  30.23 
 
 
334 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0211  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.63 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.51 
 
 
453 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  30.75 
 
 
374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.07 
 
 
512 aa  126  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  32.12 
 
 
320 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.73 
 
 
414 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0189  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.81 
 
 
403 aa  123  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.17 
 
 
443 aa  122  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>