More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0683 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  92.19 
 
 
474 aa  881    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  92.19 
 
 
474 aa  881    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0805  amino acid permease family protein  91.8 
 
 
456 aa  842    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  92.19 
 
 
474 aa  881    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  92.11 
 
 
474 aa  878    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0845  amino acid permease family protein  91.8 
 
 
456 aa  842    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  93.28 
 
 
474 aa  872    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  92.19 
 
 
474 aa  882    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  100 
 
 
471 aa  939    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  92.19 
 
 
474 aa  880    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  93.28 
 
 
474 aa  875    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  59.87 
 
 
465 aa  579  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  60.13 
 
 
465 aa  578  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  59.91 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  59.91 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  59.7 
 
 
465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  59.7 
 
 
465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  59.91 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  59.66 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  58.8 
 
 
465 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  59.48 
 
 
465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1782  amino acid permease-associated region  58.39 
 
 
473 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0537  amino acid permease-associated region  58 
 
 
474 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  55.41 
 
 
474 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  38.94 
 
 
478 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  38.72 
 
 
478 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  35.76 
 
 
472 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  35.88 
 
 
480 aa  243  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  36.29 
 
 
471 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  36.29 
 
 
471 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  36.08 
 
 
471 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  34.27 
 
 
468 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  36.08 
 
 
471 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  35.86 
 
 
471 aa  226  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  32.83 
 
 
475 aa  225  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  36.34 
 
 
475 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  36.5 
 
 
475 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  34.19 
 
 
467 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  35.2 
 
 
475 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  35.65 
 
 
475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  35.65 
 
 
475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  35.65 
 
 
475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  35.65 
 
 
475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  35.65 
 
 
475 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  35.44 
 
 
471 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  35.23 
 
 
471 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  35.19 
 
 
475 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  35.84 
 
 
475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  35.21 
 
 
475 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  33.8 
 
 
486 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  33.8 
 
 
486 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  33.8 
 
 
506 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  33.8 
 
 
486 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  33.8 
 
 
486 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  33.8 
 
 
486 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  33.8 
 
 
506 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  33.8 
 
 
486 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1002  arginine/ornithine antiporter  34.43 
 
 
475 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  35.44 
 
 
471 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1039  arginine/ornithine antiporter  34.59 
 
 
475 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808656  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1001  arginine/ornithine antiporter  34.35 
 
 
475 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4384  arginine/ornithine antiporter  34.03 
 
 
475 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.669533  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  34.43 
 
 
475 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  33.9 
 
 
476 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  33.9 
 
 
476 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  31.77 
 
 
493 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2660  arginine/ornithine antiporter  33.86 
 
 
475 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  33.33 
 
 
496 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  32.75 
 
 
484 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  34.5 
 
 
475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68300  arginine/ornithine antiporter  35.27 
 
 
482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000378428  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1484  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  33.18 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0574434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  33.78 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5910  arginine/ornithine antiporter  35.5 
 
 
482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0569669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2320  amino acid transporter  30.02 
 
 
526 aa  196  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0072  amino acid permease  32.95 
 
 
671 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1571  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  32.95 
 
 
663 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0188747  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  30.54 
 
 
440 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2905  arginine/ornithine antiporter  32.07 
 
 
473 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  34.03 
 
 
475 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  34.03 
 
 
480 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2174  arginine/ornithine antiporter  33.18 
 
 
492 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5574  arginine/ornithine antiporter  32.47 
 
 
493 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01574  predicted arginine/ornithine antiporter transporter  30.88 
 
 
460 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.424719  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1645  arginine/ornithine antiporter  32.14 
 
 
460 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.498381  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2038  arginine/ornithine antiporter  30.88 
 
 
460 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000756362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1594  arginine/ornithine antiporter  30.88 
 
 
460 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132259  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2025  arginine/ornithine antiporter  30.88 
 
 
460 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01564  hypothetical protein  30.88 
 
 
460 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.358572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1680  putative arginine/ornithine antiporter  30.88 
 
 
460 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.982096  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1813  putative arginine/ornithine antiporter  30.88 
 
 
460 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00102354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1586  arginine/ornithine antiporter  32.14 
 
 
460 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916366  normal  0.560128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1577  arginine/ornithine antiporter  32.14 
 
 
460 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933609  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  31.22 
 
 
460 aa  186  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1697  arginine/ornithine antiporter  32.14 
 
 
460 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1002  arginine/ornithine antiporter  34.5 
 
 
475 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  30.88 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1878  arginine/ornithine APC family antiporter  32.71 
 
 
493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  32.86 
 
 
475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1847  arginine/ornithine antiporter  32.04 
 
 
460 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.861199  normal  0.0965348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>