More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0497 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  82.55 
 
 
235 aa  394  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  80.43 
 
 
235 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  80.43 
 
 
235 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  78.72 
 
 
235 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  78.72 
 
 
235 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  78.72 
 
 
235 aa  381  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  78.72 
 
 
235 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  78.72 
 
 
235 aa  381  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  77.68 
 
 
224 aa  359  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  52 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  44.59 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  44.59 
 
 
240 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  43.69 
 
 
240 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  43.24 
 
 
240 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  43.05 
 
 
237 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 
239 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  42.04 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  42.04 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  42.04 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  41.99 
 
 
239 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  41.99 
 
 
239 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  41.99 
 
 
239 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  41.99 
 
 
239 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  41.99 
 
 
239 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  37.39 
 
 
227 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.3 
 
 
246 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  37.95 
 
 
226 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  37.61 
 
 
222 aa  157  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  38.07 
 
 
222 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  34.78 
 
 
231 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  36.94 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.7 
 
 
228 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  34.78 
 
 
231 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.86 
 
 
231 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  36 
 
 
228 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  35.62 
 
 
228 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  33.94 
 
 
230 aa  148  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  30.91 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1119  response regulator  37.44 
 
 
241 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.704841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  33.03 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  33.49 
 
 
230 aa  144  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  34.23 
 
 
230 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  34.98 
 
 
228 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  33.49 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  33.49 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.23 
 
 
230 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1922  response regulator  36.12 
 
 
229 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  33.03 
 
 
230 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.93 
 
 
220 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.93 
 
 
220 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  33.03 
 
 
230 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.93 
 
 
217 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  37.22 
 
 
225 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.48 
 
 
220 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  31.56 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.04 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.48 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  34.09 
 
 
223 aa  138  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  32.73 
 
 
224 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  31.11 
 
 
224 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  32.42 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.59 
 
 
233 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.78 
 
 
228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0196  response regulator receiver and unknown domain protein  29.65 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  28.64 
 
 
223 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  28.44 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  31.56 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  31.36 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.26 
 
 
233 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  30.8 
 
 
227 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  30.26 
 
 
233 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  30.26 
 
 
233 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.19 
 
 
228 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  29.91 
 
 
228 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1452  response regulator receiver and unknown domain protein  31.56 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  32.27 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  29.46 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  31.51 
 
 
232 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.79 
 
 
236 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.33 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  28.7 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  29.91 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  29.36 
 
 
226 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  29.2 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  29.02 
 
 
225 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  29.02 
 
 
225 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>