More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0232 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  89.5 
 
 
361 aa  670    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  89.5 
 
 
361 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  89.78 
 
 
361 aa  670    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  89.78 
 
 
361 aa  670    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  90.88 
 
 
362 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 
362 aa  741    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  89.78 
 
 
361 aa  671    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  90.06 
 
 
361 aa  674    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  89.78 
 
 
361 aa  670    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  68.89 
 
 
364 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  65.47 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  51.52 
 
 
356 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  51.52 
 
 
356 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  49.6 
 
 
383 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  49.72 
 
 
357 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  49.48 
 
 
393 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  48.75 
 
 
361 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  49.16 
 
 
362 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  48.07 
 
 
361 aa  355  5.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  50.55 
 
 
352 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  48.91 
 
 
367 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  49.58 
 
 
351 aa  351  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  49.31 
 
 
351 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  48.75 
 
 
351 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  47.96 
 
 
365 aa  345  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  46.87 
 
 
370 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  48.24 
 
 
376 aa  343  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  48.11 
 
 
366 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  50 
 
 
349 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  44.84 
 
 
371 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  46.54 
 
 
376 aa  328  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  45.17 
 
 
343 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  44.02 
 
 
366 aa  325  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  44.84 
 
 
367 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  44.84 
 
 
364 aa  319  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  47.25 
 
 
359 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  44.84 
 
 
364 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  44.84 
 
 
364 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  44.84 
 
 
364 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  44.84 
 
 
364 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  44.84 
 
 
364 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  44.84 
 
 
364 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  44.84 
 
 
364 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  44.44 
 
 
364 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  44.44 
 
 
364 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  44.44 
 
 
364 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  47.21 
 
 
351 aa  315  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  43.87 
 
 
364 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  43.9 
 
 
364 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  43.9 
 
 
364 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  43.21 
 
 
366 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  44.57 
 
 
364 aa  309  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  47.63 
 
 
347 aa  310  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  42.23 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  40.73 
 
 
348 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  44.35 
 
 
375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  43.87 
 
 
372 aa  302  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  45.1 
 
 
358 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  44.76 
 
 
339 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  42.34 
 
 
348 aa  296  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  43.28 
 
 
376 aa  295  9e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  42.47 
 
 
363 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  41.18 
 
 
367 aa  293  4e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  43.67 
 
 
376 aa  292  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  43.09 
 
 
389 aa  291  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 
360 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  40.72 
 
 
360 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  44.23 
 
 
379 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  44.35 
 
 
382 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  40.82 
 
 
363 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  44.35 
 
 
362 aa  289  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  43.41 
 
 
377 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  42.47 
 
 
369 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  42.98 
 
 
353 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  43.68 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  41.85 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  40.33 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  41.96 
 
 
400 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  42.9 
 
 
355 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  42.42 
 
 
369 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  42.66 
 
 
353 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  41.19 
 
 
350 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  39.11 
 
 
360 aa  276  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  40.66 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  42.43 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  41.48 
 
 
371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  43.45 
 
 
386 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  41.47 
 
 
380 aa  271  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  41.08 
 
 
363 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  42.16 
 
 
371 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  41.05 
 
 
377 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  42.16 
 
 
371 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  42.21 
 
 
348 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0230  D-alanine-D-alanine ligase, N-terminus  89.26 
 
 
158 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  42.49 
 
 
348 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  41.8 
 
 
373 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  39.66 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  40.67 
 
 
360 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  41.99 
 
 
394 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  38.9 
 
 
383 aa  265  8e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>