More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0137 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
145 aa  301  2e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.51399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.63354e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.03793e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.80183e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.75046e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  97.24 
 
 
145 aa  295  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.45264e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  95.86 
 
 
145 aa  293  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.68177e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  95.86 
 
 
145 aa  292  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.49627e-09  hitchhiker  1.137e-08 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  95.17 
 
 
145 aa  289  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  9.86136e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  84.83 
 
 
145 aa  258  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.14694e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  80.69 
 
 
145 aa  249  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  67.59 
 
 
145 aa  212  1e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  67.59 
 
 
145 aa  212  1e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.76479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  67.59 
 
 
145 aa  211  4e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  67.86 
 
 
144 aa  197  4e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.46357e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 
143 aa  194  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.56517e-13  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  64.14 
 
 
144 aa  190  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.60952e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 
143 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.58972e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  64.71 
 
 
142 aa  189  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
143 aa  188  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.78919e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  65 
 
 
142 aa  188  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.31451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 
147 aa  188  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.58182e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
148 aa  187  3e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  4.52598e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
148 aa  188  3e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  8.3935e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 
142 aa  188  3e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
148 aa  187  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  7.49109e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  62.86 
 
 
142 aa  186  6e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.54571e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
147 aa  186  6e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 
144 aa  186  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 
142 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 
142 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.18525e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
144 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.19018e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
149 aa  185  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
149 aa  185  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.00491e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 
145 aa  184  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.18025e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 
142 aa  184  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.23224e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  184  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.22799e-07  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  63.04 
 
 
148 aa  184  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  61.43 
 
 
145 aa  184  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.16087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 
142 aa  183  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.15233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  183  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  182  1e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
146 aa  181  2e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  61.43 
 
 
148 aa  181  2e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.40761e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  182  2e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
147 aa  182  2e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  181  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  1.51129e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 
143 aa  181  4e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.97035e-08  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
144 aa  180  5e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.32589e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  180  5e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.52627e-09  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  59.29 
 
 
145 aa  180  5e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  1.19852e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  180  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.72076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  57.86 
 
 
144 aa  180  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.27467e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  180  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.6322e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  180  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.6356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
147 aa  179  8e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 
143 aa  179  8e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  9.36521e-09  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.44686e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.42951e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  7.56717e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.00436e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  3.2614e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.95186e-07  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  6.30317e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.8374e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.36634e-07  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  3.11613e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  4.82392e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  179  9e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 
142 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.38225e-05  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  178  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 
144 aa  178  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.00743e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.33795e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
146 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  178  3e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.2865e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
176 aa  177  3e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  5.10805e-07  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  178  3e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  9.8694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  178  3e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  61.76 
 
 
143 aa  178  3e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.18039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 
144 aa  178  3e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  6.97609e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  178  3e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  178  3e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.15689e-12  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.56516e-10  hitchhiker  4.50928e-05 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  1.8745e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.78048e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.57129e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
143 aa  177  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.49881e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 
143 aa  177  5e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.82384e-07  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  57.14 
 
 
154 aa  177  5e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
142 aa  177  5e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.75017e-09  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
176 aa  177  5e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>