More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0136 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  91.5 
 
 		 252 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  90.69 
 
 		 252 aa  480  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  91.9 
 
 		 247 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  91.9 
 
 		 252 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  90.69 
 
 		 247 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  90.69 
 
 		 247 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  90.69 
 
 		 247 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  90.69 
 
 		 247 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  90.28 
 
 		 252 aa  477  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  91.09 
 
 		 252 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  60.16 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  57.32 
 
 		 258 aa  296  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  49.59 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  44.98 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  44.53 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  44.18 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  44.08 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  42.74 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  42.74 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  43.72 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  43.32 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  41.98 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  45.38 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  45.12 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  43.09 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  40.49 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  43.6 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  40.82 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  41.2 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  39.22 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  40.96 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  40.96 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  42.04 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  41.27 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1800  tRNA pseudouridine synthase A  42.74 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  41.22 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  39.43 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  40.56 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  42.51 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  42.51 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2707  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.580118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 		 305 aa  175  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 		 261 aa  174  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  36.89 
 
 		 271 aa  174  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0020  tRNA pseudouridine synthase A  38.78 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  39.59 
 
 		 245 aa  171  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  37.04 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  34.27 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  36.89 
 
 		 351 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  34.27 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  34.55 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.15 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2224  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0737509  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0571  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217469  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1931  tRNA pseudouridine synthase A  36.13 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  37.04 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  34.96 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  37.25 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  35.8 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  35.37 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  36.21 
 
 		 261 aa  164  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  35.37 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  35.37 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>