More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0116 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
179 aa  362  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.21875e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  97.77 
 
 
179 aa  356  8e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  97.77 
 
 
179 aa  356  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.41034e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  96.09 
 
 
179 aa  351  3e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  9.73841e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  96.09 
 
 
179 aa  350  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.05231e-10  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  96.09 
 
 
179 aa  350  6e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  96.09 
 
 
179 aa  350  6e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.84973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  96.09 
 
 
179 aa  350  6e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.67515e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  96.09 
 
 
179 aa  350  6e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.4971e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  95.53 
 
 
179 aa  348  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.42561e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  95.53 
 
 
179 aa  348  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.10602e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  88.83 
 
 
179 aa  329  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  87.71 
 
 
179 aa  327  5e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  84.36 
 
 
179 aa  314  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  84.36 
 
 
179 aa  314  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  83.24 
 
 
179 aa  311  3e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 
180 aa  294  5e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  8.32727e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 
180 aa  291  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.53221e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  76.97 
 
 
180 aa  290  6e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.7583e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
180 aa  287  5e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  74.3 
 
 
179 aa  286  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.57124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
180 aa  283  8e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
180 aa  282  2e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.63356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 
179 aa  279  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  69.83 
 
 
179 aa  277  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  72.63 
 
 
180 aa  276  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  72.73 
 
 
183 aa  275  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 
178 aa  270  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  5.8995e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  70.62 
 
 
179 aa  270  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  70.62 
 
 
179 aa  270  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  69.27 
 
 
180 aa  268  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  68.54 
 
 
180 aa  266  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.55601e-08  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  69.27 
 
 
181 aa  266  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  8.36347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  69.27 
 
 
182 aa  263  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 
179 aa  262  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 
179 aa  261  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  65.91 
 
 
180 aa  261  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  1.81617e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  260  9e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  65.73 
 
 
180 aa  259  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  257  5e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  66.29 
 
 
180 aa  257  5e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.36649e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 
179 aa  257  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.38083e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 
180 aa  257  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  256  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67314e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.60301e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 
180 aa  255  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.53341e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  60.89 
 
 
179 aa  255  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  5.68765e-09  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  60.89 
 
 
179 aa  254  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
180 aa  254  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  253  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
179 aa  253  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  252  2e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.74066e-07  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  252  2e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.26613e-05  unclonable  1.44866e-11 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  62.15 
 
 
179 aa  252  2e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  252  2e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.891e-13  hitchhiker  1.42331e-08 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
180 aa  251  3e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  251  4e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.50399e-07  hitchhiker  1.69962e-09 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 
179 aa  251  4e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  251  5e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.87667e-07  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  251  5e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.74213e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  251  5e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  251  5e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.08905e-07  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  250  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  249  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  249  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.3393e-09  unclonable  8.47343e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 
179 aa  249  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.84321e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 
192 aa  248  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  248  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  3.87746e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
179 aa  247  5e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.53515e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
182 aa  247  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  7.77115e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
179 aa  248  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  64 
 
 
191 aa  247  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
184 aa  247  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.09145e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
180 aa  247  8e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
179 aa  246  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  246  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  246  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.91972e-07  unclonable  1.25829e-08 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 
193 aa  246  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  246  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.91784e-05  decreased coverage  1.59528e-12 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  246  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
179 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.16279e-08  unclonable  5.74011e-11 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
179 aa  246  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  3.06823e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  246  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
220 aa  245  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  61.24 
 
 
179 aa  245  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  1.38257e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  245  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.06117e-06  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
179 aa  245  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
179 aa  245  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.88699e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
179 aa  245  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  7.28696e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 
181 aa  246  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 
179 aa  245  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
179 aa  244  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  7.13607e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  244  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  1.46206e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  244  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
179 aa  244  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>