More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0002 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  94.49 
 
 		 381 aa  743    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 381 aa  773    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  95.28 
 
 		 379 aa  734    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  95.28 
 
 		 379 aa  734    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  95.8 
 
 		 379 aa  737    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  96.06 
 
 		 379 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  95.8 
 
 		 379 aa  740    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  96.33 
 
 		 381 aa  755    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  96.06 
 
 		 379 aa  739    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  95.8 
 
 		 379 aa  737    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  96.33 
 
 		 381 aa  755    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  74.02 
 
 		 378 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  71.39 
 
 		 378 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  53.4 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.02 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.02 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.21 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  44.65 
 
 		 376 aa  319  6e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  42.15 
 
 		 376 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  41.88 
 
 		 376 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  41.88 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  41.62 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  41.62 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  40.58 
 
 		 376 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  41.36 
 
 		 376 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  41.1 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  40.58 
 
 		 376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  41.25 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  41.99 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.79 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.79 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.6 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.96 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.24 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.32 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  37.6 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.91 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  35 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.49 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.43 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.48 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  34.65 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.83 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.77 
 
 		 374 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.55 
 
 		 372 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.23 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.71 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.71 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  29.46 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  30.39 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.97 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  31.09 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  31.35 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  31.09 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  29.95 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  29.82 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  29.97 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.47 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  29.56 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  32.64 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 		 372 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.39 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  30.13 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.61 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.06 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  30.31 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.19 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.49 
 
 		 372 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  27.91 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  30.33 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 		 372 aa  173  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.72 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.05 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.31 
 
 		 397 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  27.91 
 
 		 372 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  28.83 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.7 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  27.39 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.6 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.38 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.12 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.12 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.79 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.05 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  33.08 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  33.08 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>