86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7733 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  100 
 
 
163 aa  330  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  95.71 
 
 
163 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  95.71 
 
 
163 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  94.48 
 
 
163 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  94.48 
 
 
163 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  93.25 
 
 
163 aa  276  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  87.12 
 
 
193 aa  265  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  85.89 
 
 
163 aa  243  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.46 
 
 
165 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.46 
 
 
165 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  69.33 
 
 
166 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  70.37 
 
 
166 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.1 
 
 
194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  66.46 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  57.32 
 
 
161 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  55.9 
 
 
162 aa  157  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  55.86 
 
 
162 aa  141  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  44.44 
 
 
154 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  42.59 
 
 
153 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  40.37 
 
 
150 aa  107  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  39.13 
 
 
151 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  36.97 
 
 
153 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  38.65 
 
 
154 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  40.49 
 
 
154 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  40.36 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  39.38 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  42.33 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  41.6 
 
 
157 aa  92  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  38.18 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  41.03 
 
 
152 aa  89  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  30.3 
 
 
153 aa  87  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  40.8 
 
 
151 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  38.36 
 
 
151 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  35.19 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  33.74 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  37.11 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  42.5 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  30.22 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 
198 aa  53.9  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.67 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 
203 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  34.07 
 
 
120 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  27.97 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.91 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  26.8 
 
 
204 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  34.67 
 
 
195 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 
199 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 
199 aa  44.7  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 
199 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  30.85 
 
 
203 aa  43.9  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  26.32 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  26.05 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  31.87 
 
 
82 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.23 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  25.77 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  42.37 
 
 
78 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  29.79 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  27.37 
 
 
200 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  27.37 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  27.17 
 
 
203 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  28.72 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  26.32 
 
 
200 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 
213 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 
199 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 
199 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  25.53 
 
 
200 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  26.6 
 
 
199 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  28.26 
 
 
206 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
206 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  25.26 
 
 
200 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0636  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.11 
 
 
210 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 
198 aa  40.8  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  25.26 
 
 
200 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>