More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7692 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  97.14 
 
 
384 aa  728    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  94.79 
 
 
384 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  93.75 
 
 
384 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
384 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  84.92 
 
 
378 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  94.79 
 
 
384 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  97.14 
 
 
384 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  96.61 
 
 
384 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  86.97 
 
 
380 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  85.79 
 
 
380 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  85.79 
 
 
380 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  85.79 
 
 
372 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  85.79 
 
 
380 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  85.79 
 
 
380 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  85.79 
 
 
380 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  87.25 
 
 
380 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  86.97 
 
 
380 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.69 
 
 
380 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  86.4 
 
 
376 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  86.69 
 
 
380 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.69 
 
 
380 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  86.4 
 
 
380 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  86.69 
 
 
380 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.4 
 
 
380 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  86.4 
 
 
391 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  86.4 
 
 
380 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.4 
 
 
380 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.4 
 
 
380 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  86.4 
 
 
391 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  80.52 
 
 
402 aa  620  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  81.15 
 
 
381 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  80.63 
 
 
381 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  79.55 
 
 
386 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  79.26 
 
 
386 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  75.62 
 
 
369 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  76.34 
 
 
377 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  73.95 
 
 
381 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  70.9 
 
 
401 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  70.62 
 
 
401 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  69.32 
 
 
400 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  69.6 
 
 
399 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  68 
 
 
401 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  69.97 
 
 
384 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  68.38 
 
 
393 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.9 
 
 
399 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  70.24 
 
 
336 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  64.77 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  61.3 
 
 
399 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.5 
 
 
404 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  59.37 
 
 
381 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  59.73 
 
 
382 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  61.38 
 
 
460 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  60.52 
 
 
380 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  55.21 
 
 
398 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  51.37 
 
 
371 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  52.86 
 
 
376 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  52.29 
 
 
375 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  51.51 
 
 
375 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  52.5 
 
 
401 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  52.66 
 
 
380 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  50.13 
 
 
376 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  49.6 
 
 
376 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  51 
 
 
381 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  52 
 
 
376 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  49.07 
 
 
382 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
383 aa  349  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  49.47 
 
 
380 aa  348  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  50.87 
 
 
375 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.81 
 
 
382 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  49.57 
 
 
377 aa  345  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  50.55 
 
 
382 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  52.2 
 
 
380 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  50.14 
 
 
376 aa  342  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  49.14 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50 
 
 
379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  47.35 
 
 
377 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  46.76 
 
 
376 aa  335  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  50 
 
 
379 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  50 
 
 
379 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  50 
 
 
379 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.73 
 
 
379 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  46.93 
 
 
383 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.73 
 
 
375 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  47.23 
 
 
381 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  49.73 
 
 
379 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.73 
 
 
379 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  49.73 
 
 
379 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  48.74 
 
 
379 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  49.44 
 
 
379 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  49.44 
 
 
379 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  49.44 
 
 
379 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  48.74 
 
 
379 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  47.63 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  48.63 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  47.73 
 
 
383 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  47.53 
 
 
373 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1959  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.28 
 
 
405 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.28 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.28 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  46.28 
 
 
405 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>