More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7671 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  93.62 
 
 
188 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  93.09 
 
 
188 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  92.55 
 
 
188 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  92.55 
 
 
188 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  92.55 
 
 
188 aa  362  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  91.49 
 
 
188 aa  346  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  77.3 
 
 
188 aa  305  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  76.76 
 
 
188 aa  290  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
211 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 
188 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
201 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
189 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 
193 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
193 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
192 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
193 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  31.03 
 
 
176 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
192 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
195 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
181 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
194 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  33.33 
 
 
189 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  32.93 
 
 
195 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
191 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  34.55 
 
 
179 aa  99  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
187 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  30.94 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  30.73 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
195 aa  94.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
185 aa  94.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
600 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  30.18 
 
 
189 aa  87.8  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  30.91 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  28.98 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
206 aa  58.2  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
234 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
199 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
215 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  23.86 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>