More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7659 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 340 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  70.09 
 
 		 341 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  50.29 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  50.29 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  49.4 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  47.08 
 
 		 357 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  47.08 
 
 		 357 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  39.22 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  39.27 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  38.55 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  38.86 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  38.86 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  38.97 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  38.32 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  38.62 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  38.55 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  37.31 
 
 		 358 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  38.86 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  38.86 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  38.86 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  36.07 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  38.62 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  38.62 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  38.78 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  37.32 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  34.07 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  37.08 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  37.24 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  35.69 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  33.15 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  36.47 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  37.9 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  34.75 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  34.24 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  34.25 
 
 		 341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  34.55 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  35.74 
 
 		 344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  34.47 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  33.13 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  34.66 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  38.7 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  34.53 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.2 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  34.06 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  31.47 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31.15 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  31.87 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  31.87 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  32.13 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.34 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  31.59 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  33.52 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31.64 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31.64 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31.64 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31.64 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  31.9 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  31.64 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  30 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  31.64 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.19 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  30.37 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  30.89 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  30.89 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  32.84 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  29.4 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  31.52 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  30.15 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  32.54 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  29.38 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  32.54 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  29.7 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  30.03 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  31.37 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  30.19 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  29.92 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  29.33 
 
 		 393 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  29.2 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  32.28 
 
 		 400 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  32.7 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  31.36 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  32.82 
 
 		 407 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  30.35 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  29.32 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  30.61 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  30.35 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  32.75 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  32.73 
 
 		 419 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  32.97 
 
 		 394 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  30.79 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  29.2 
 
 		 386 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  29.2 
 
 		 386 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  32.61 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  30.25 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  30.26 
 
 		 409 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  30.26 
 
 		 409 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.44 
 
 		 374 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  30.11 
 
 		 391 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  30.7 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  32.37 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>