More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7622 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  95.67 
 
 
439 aa  798    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  82.69 
 
 
440 aa  684    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  100 
 
 
439 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  95.44 
 
 
439 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  93.62 
 
 
439 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  93.62 
 
 
439 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  95.44 
 
 
439 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  79.5 
 
 
439 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  66.43 
 
 
436 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  48.55 
 
 
450 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  49.53 
 
 
437 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  41.59 
 
 
453 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  41.59 
 
 
453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  41.8 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  41.59 
 
 
453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  41.59 
 
 
453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  41.59 
 
 
453 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 
453 aa  340  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  41.59 
 
 
453 aa  340  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  41.59 
 
 
453 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 
449 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 
449 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  41.41 
 
 
427 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  42.24 
 
 
438 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  41.57 
 
 
436 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  41.27 
 
 
436 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  42.86 
 
 
447 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  41.8 
 
 
447 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  41.34 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  42.24 
 
 
431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 
432 aa  299  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 
431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  32.86 
 
 
430 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  33.02 
 
 
430 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  33.02 
 
 
430 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  32.86 
 
 
430 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  33.02 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  33.02 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  33.8 
 
 
429 aa  253  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  36.12 
 
 
449 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  32.78 
 
 
430 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  32.78 
 
 
430 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  33.72 
 
 
432 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  33.72 
 
 
432 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  33.72 
 
 
432 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  35.54 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  35.54 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  35.76 
 
 
448 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 
442 aa  239  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  33.65 
 
 
436 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  36.01 
 
 
435 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.94 
 
 
456 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  32.78 
 
 
430 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  33.57 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  34.19 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 
425 aa  232  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  36.19 
 
 
436 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  33.81 
 
 
436 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 
443 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  35.92 
 
 
436 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  33.73 
 
 
454 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  33.73 
 
 
454 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  35.68 
 
 
436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  35.68 
 
 
436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  35.68 
 
 
436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  33.71 
 
 
447 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  35.1 
 
 
428 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  32.03 
 
 
434 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  33.18 
 
 
466 aa  226  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  33.25 
 
 
454 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  33.25 
 
 
454 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  31.83 
 
 
453 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  34.36 
 
 
449 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  33.89 
 
 
478 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  33.49 
 
 
455 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 
458 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
453 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  33.41 
 
 
449 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  33.02 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  34.89 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.97 
 
 
448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  34.84 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  34.84 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  34.84 
 
 
479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  32.69 
 
 
428 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  32.69 
 
 
428 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  35.76 
 
 
436 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  34.38 
 
 
463 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  31.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  31.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  31.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  31.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  30.02 
 
 
468 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  31.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  31.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  31.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  31.44 
 
 
444 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  34.14 
 
 
463 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>