58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7539 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  26.45 
 
 
2490 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  34.31 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1957  methyltransferase type 11  25.54 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  26.78 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  26 
 
 
214 aa  56.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  32.26 
 
 
230 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
214 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
289 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  23.01 
 
 
293 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5941  hypothetical protein  56.1 
 
 
71 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  51.92 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  30.32 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  26.63 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
210 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  26.52 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.59 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  32.43 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.83 
 
 
345 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  21.36 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
237 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  26.37 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.23 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  31.76 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  24.73 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  27.74 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
284 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  25.14 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1206  methyltransferase type 11  24.63 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  31.97 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.71 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  28.11 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  31.75 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  23.63 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0296  hypothetical protein  22.77 
 
 
283 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2872  hypothetical protein  23.98 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  30.68 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  25.54 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  25.4 
 
 
212 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0235  hypothetical protein  25.38 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  23.08 
 
 
212 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  25.95 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  26.58 
 
 
305 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25.21 
 
 
304 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
217 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
706 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.74 
 
 
237 aa  42  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  24.41 
 
 
281 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  25.2 
 
 
212 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>