91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7476 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  81.4 
 
 
414 aa  707    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  86.06 
 
 
419 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  90.38 
 
 
416 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  90.38 
 
 
416 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  90.38 
 
 
416 aa  763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  86.06 
 
 
419 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  80.68 
 
 
414 aa  705    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
414 aa  844    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  76.81 
 
 
413 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  64.41 
 
 
413 aa  548  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  57.91 
 
 
407 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  49.04 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  48.42 
 
 
432 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  47.96 
 
 
419 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  46.49 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  45.21 
 
 
393 aa  335  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  45.59 
 
 
388 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  46.19 
 
 
392 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  44.55 
 
 
389 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  43.48 
 
 
394 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  47.36 
 
 
394 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  43.38 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  42.51 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  45.06 
 
 
422 aa  305  8.000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  42.79 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  40.48 
 
 
422 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  42.93 
 
 
409 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  40.34 
 
 
410 aa  269  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  39.46 
 
 
408 aa  269  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  42.48 
 
 
420 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  40.64 
 
 
419 aa  260  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  42.22 
 
 
419 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  41.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  38.18 
 
 
421 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  41.95 
 
 
419 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  41.95 
 
 
419 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  40.96 
 
 
430 aa  255  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  43.54 
 
 
421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  38.37 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  41.99 
 
 
406 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  38.5 
 
 
404 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.52 
 
 
410 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  38.18 
 
 
418 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.08 
 
 
390 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  35.29 
 
 
502 aa  204  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.37 
 
 
398 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.26 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.89 
 
 
389 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.89 
 
 
389 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  37.44 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  37.15 
 
 
391 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  30.07 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  34.65 
 
 
402 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  32.1 
 
 
377 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  32.78 
 
 
436 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
427 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  26.83 
 
 
1506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  28.37 
 
 
498 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  31.49 
 
 
382 aa  93.2  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  34.93 
 
 
378 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  36.81 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  32.04 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  35.44 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  27.92 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  31.72 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  32.45 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  27.09 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  27.59 
 
 
350 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  32.17 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  27.32 
 
 
345 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  29.75 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  29.1 
 
 
324 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  27.03 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  26.76 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  24.26 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  29.86 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 
352 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 
352 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  24.65 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  32.48 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  25.35 
 
 
352 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  26.79 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  27.64 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  27.08 
 
 
353 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  31.17 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  24.24 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  24.24 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  23.48 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  22.11 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  23.48 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>