More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7454 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
383 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  51.69 
 
 
383 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  51.42 
 
 
414 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  51.69 
 
 
384 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  51.69 
 
 
384 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  51.69 
 
 
384 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  51.69 
 
 
384 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  51.69 
 
 
384 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  51.69 
 
 
384 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  51.69 
 
 
384 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  50.13 
 
 
384 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  53.57 
 
 
386 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  50.13 
 
 
384 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  50.39 
 
 
384 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  49.48 
 
 
383 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  52.5 
 
 
386 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  49.75 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  50.82 
 
 
384 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  52.05 
 
 
385 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  50.82 
 
 
384 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  50.79 
 
 
381 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  50.82 
 
 
384 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  50 
 
 
396 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  49.22 
 
 
383 aa  361  9e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  48.98 
 
 
394 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  50.13 
 
 
384 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  48.96 
 
 
382 aa  348  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  46.07 
 
 
381 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  48.29 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  47.66 
 
 
382 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  45.5 
 
 
386 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  46.17 
 
 
383 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  45.92 
 
 
383 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  46.68 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  46.68 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  46.68 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  44.19 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  46.68 
 
 
379 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  46.43 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45.81 
 
 
374 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  46.02 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  46.95 
 
 
381 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  44.76 
 
 
381 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  46.27 
 
 
380 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  44.56 
 
 
381 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  46.02 
 
 
380 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.85 
 
 
379 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.9 
 
 
381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  44.2 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  43.17 
 
 
389 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  43.17 
 
 
389 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  43.28 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  44.56 
 
 
375 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  43.28 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  42.9 
 
 
389 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  43.41 
 
 
383 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  43.41 
 
 
383 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  42.18 
 
 
409 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  42.18 
 
 
409 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  41.94 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  42.93 
 
 
384 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.01 
 
 
375 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  41.86 
 
 
384 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  42.75 
 
 
375 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  42.75 
 
 
375 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  40.98 
 
 
380 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  38.54 
 
 
385 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  43.56 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  41.3 
 
 
376 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41.46 
 
 
380 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.2 
 
 
383 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.2 
 
 
383 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.59 
 
 
385 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.35 
 
 
385 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  39.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  41.18 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  41.18 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  39.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  39.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  39.5 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  39.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.85 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  39.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.2 
 
 
383 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  42.5 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  41.05 
 
 
403 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.9 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.9 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.9 
 
 
436 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.9 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.25 
 
 
436 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  41.78 
 
 
389 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.9 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.9 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.1 
 
 
383 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  40.6 
 
 
380 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  41.13 
 
 
366 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  40 
 
 
471 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  41.1 
 
 
380 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  39.75 
 
 
383 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>