More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7451 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1408  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0263821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1450  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.756367  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3287  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1301  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.828365  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5515  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4768  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4505  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3599  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5895  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0445545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0947  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 331 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6961  transcriptional regulator, LysR family  37.99 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.33 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.54 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4296  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  29.15 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  29.15 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5141  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.730925 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0795  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.556779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26270  putative transcriptional regulator  31.51 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.338283  normal  0.903696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2801  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  32.61 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.05 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  26.13 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2998  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2701  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3051  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3086  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.22 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  30.43 
 
 		 289 aa  95.5  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1720  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3239  DNA-binding transcriptional activator TdcA  28.99 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3306  DNA-binding transcriptional activator TdcA  28.99 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>