78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7444 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  85.67 
 
 		 363 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  85.67 
 
 		 363 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 363 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  85.4 
 
 		 363 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 381 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  22.64 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.53 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  26.58 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  25.58 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  28.73 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  25.46 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  25.26 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.95 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  25.94 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.35 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  21.04 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  21.84 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  24.07 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  23.74 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  24 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  19.09 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  25 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  22.68 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  25.48 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  26.76 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  21.25 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 368 aa  53.1  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  26.11 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  22.76 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 180 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  25.16 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 188 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 		 588 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  24.6 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 545 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2543  transcriptional regulator, LuxR family  57.45 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  24.19 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  24.39 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  27.89 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  38.57 
 
 		 568 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  34.38 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>