More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7429 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7429  ABC efflux pump, ATPase subunit  100 
 
 
337 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0346135  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6511  ABC transporter related  91.1 
 
 
340 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192543  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5655  ABC transporter related  91.39 
 
 
337 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305234  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6020  ABC transporter related  91.39 
 
 
337 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.628016  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6132  ABC transporter related  87.24 
 
 
337 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  decreased coverage  0.00989011 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3152  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0700  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.430015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0122  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
356 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1466  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
356 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2894  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
356 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0535  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
347 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0517  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3043  ABC transporter related  36.36 
 
 
314 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0610173 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1932  ABC transporter related  35.41 
 
 
209 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  33.6 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  41.34 
 
 
319 aa  95.9  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.63 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  33.91 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  39.58 
 
 
302 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
299 aa  92.8  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  37.97 
 
 
388 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  28.5 
 
 
234 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  34.53 
 
 
305 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  31.68 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  38.33 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  31.82 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  37.39 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  31.06 
 
 
339 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  34.05 
 
 
274 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  34.57 
 
 
263 aa  90.9  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4016  ABC transporter related  33.02 
 
 
265 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.276484 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.67 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  29.96 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  38.12 
 
 
302 aa  89.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
300 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  34.5 
 
 
312 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  30.17 
 
 
337 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  34.43 
 
 
308 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl646  putative multidrug ABC transporter ATP-binding component  27.03 
 
 
234 aa  89  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  29.28 
 
 
932 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30470  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.89 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.855902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  39.01 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  36.87 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  34.85 
 
 
256 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  29.75 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17610  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.1 
 
 
250 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00262944  normal  0.585837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  31.76 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  27.97 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  30 
 
 
339 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  30.58 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  35.37 
 
 
283 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  37.06 
 
 
314 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  29.17 
 
 
305 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  31.79 
 
 
741 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  37.16 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  34.59 
 
 
300 aa  86.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  37.11 
 
 
311 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  35.53 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  32.62 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  35.53 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  35.37 
 
 
283 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  35.53 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  32.81 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  30.97 
 
 
359 aa  85.9  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  31.98 
 
 
244 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  34.93 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  31.38 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  35.33 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  34.8 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  33.66 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.68 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  29.39 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  29.66 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  34.16 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.67 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  28.7 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  34.54 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  35.09 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4044  ABC transporter related  33.92 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  33.92 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  35.64 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.51 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  34.43 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  32.42 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>