More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7389 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  100 
 
 
310 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  93.55 
 
 
310 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  92.78 
 
 
291 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  75.24 
 
 
333 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  74.03 
 
 
311 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  74.03 
 
 
351 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  74.03 
 
 
311 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  66.56 
 
 
311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  57.81 
 
 
311 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  51.46 
 
 
321 aa  320  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.55 
 
 
320 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  51.48 
 
 
318 aa  315  8e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  49.51 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  49.51 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  49.19 
 
 
315 aa  311  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  50.65 
 
 
310 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  51.3 
 
 
310 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  52.51 
 
 
321 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  50.8 
 
 
317 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  49.16 
 
 
342 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  54.55 
 
 
333 aa  289  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  48.37 
 
 
319 aa  288  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  53.87 
 
 
333 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.13 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  50.34 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  50.65 
 
 
324 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  52.63 
 
 
339 aa  281  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.66 
 
 
328 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.66 
 
 
357 aa  279  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 
345 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  50.47 
 
 
345 aa  279  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.66 
 
 
342 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  47.87 
 
 
329 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  49.35 
 
 
330 aa  278  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  51.51 
 
 
324 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  51.51 
 
 
324 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  48.55 
 
 
323 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  49.67 
 
 
324 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 
322 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  49.67 
 
 
324 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
328 aa  275  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  275  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  275  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  275  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  49.84 
 
 
328 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  49.33 
 
 
321 aa  275  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
328 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  48.37 
 
 
331 aa  275  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  52.75 
 
 
333 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  48.69 
 
 
323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  51.17 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  50.84 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.5 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  50.64 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  50.67 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  50.82 
 
 
326 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  47.08 
 
 
339 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  53.38 
 
 
335 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.33 
 
 
328 aa  272  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  47.08 
 
 
339 aa  271  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  47.08 
 
 
339 aa  271  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50 
 
 
345 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.56 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.33 
 
 
363 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.56 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.56 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.56 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.56 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  50.16 
 
 
324 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  50.81 
 
 
324 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 
329 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  53.56 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  53.56 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  48.56 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  48.69 
 
 
323 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 
328 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50 
 
 
330 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  54.58 
 
 
327 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.67 
 
 
328 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.81 
 
 
324 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.56 
 
 
327 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  53.02 
 
 
332 aa  268  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47.76 
 
 
326 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  49.49 
 
 
322 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  48.37 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  54.03 
 
 
335 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  50.33 
 
 
329 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.32 
 
 
320 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  46.1 
 
 
320 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  46.1 
 
 
320 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>