More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7380 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  90.37 
 
 
201 aa  344  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  90.37 
 
 
201 aa  344  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  85.03 
 
 
201 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  63.24 
 
 
201 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.46 
 
 
202 aa  232  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  58.33 
 
 
206 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.57 
 
 
206 aa  214  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  54.12 
 
 
213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  55.19 
 
 
217 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.22 
 
 
203 aa  207  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.22 
 
 
203 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  54.73 
 
 
202 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.68 
 
 
203 aa  205  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.61 
 
 
212 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.67 
 
 
204 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  60 
 
 
202 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.79 
 
 
208 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.79 
 
 
208 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.04 
 
 
214 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.04 
 
 
214 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.01 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  56.38 
 
 
208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  53.26 
 
 
203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.21 
 
 
195 aa  198  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.35 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  51.79 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  51.35 
 
 
216 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  51.71 
 
 
232 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.71 
 
 
232 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  55.56 
 
 
203 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.98 
 
 
206 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  52.28 
 
 
202 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  55.03 
 
 
203 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  55.56 
 
 
203 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  56.76 
 
 
198 aa  191  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  56.76 
 
 
198 aa  191  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  55.03 
 
 
203 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 
207 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.71 
 
 
232 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.49 
 
 
201 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  55.91 
 
 
202 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.04 
 
 
209 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.5 
 
 
207 aa  184  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.96 
 
 
207 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.51 
 
 
205 aa  184  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  54.84 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  50.25 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.51 
 
 
204 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.89 
 
 
198 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.31 
 
 
207 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.5 
 
 
197 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.92 
 
 
211 aa  171  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  45.77 
 
 
199 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.26 
 
 
182 aa  168  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.39 
 
 
213 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.39 
 
 
213 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.28 
 
 
199 aa  158  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.8 
 
 
199 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.23 
 
 
198 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.72 
 
 
198 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.72 
 
 
198 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.72 
 
 
198 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.73 
 
 
198 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
203 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.22 
 
 
198 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.54 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.09 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  41.09 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  43 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  43 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.23 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.74 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.98 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.49 
 
 
199 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  41.09 
 
 
201 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  43 
 
 
237 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  41.09 
 
 
201 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.67 
 
 
209 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  43 
 
 
237 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  43 
 
 
237 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  43 
 
 
237 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  41.09 
 
 
201 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  43 
 
 
237 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.84 
 
 
201 aa  144  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  40.59 
 
 
201 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  41.84 
 
 
201 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  41.84 
 
 
201 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.72 
 
 
198 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.32 
 
 
204 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.65 
 
 
198 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  41.58 
 
 
201 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
200 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.22 
 
 
198 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 
207 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  39.6 
 
 
201 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.56 
 
 
200 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>