More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7322 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  48.67 
 
 
816 aa  740    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  100 
 
 
804 aa  1622    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  61.71 
 
 
847 aa  981    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  57.78 
 
 
818 aa  909    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  46.17 
 
 
813 aa  692    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  51.44 
 
 
884 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  53.95 
 
 
883 aa  796    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  42.91 
 
 
842 aa  621  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  43.55 
 
 
885 aa  618  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  37.38 
 
 
821 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  37.59 
 
 
815 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  37.06 
 
 
811 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  35.55 
 
 
843 aa  435  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.86 
 
 
800 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  37.6 
 
 
800 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  36.61 
 
 
784 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.78 
 
 
832 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 
795 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 
842 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 
795 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 
803 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 
858 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 
835 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.57 
 
 
840 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 
933 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 
793 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  34.77 
 
 
788 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 
788 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 
817 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 
803 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  33.62 
 
 
793 aa  379  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 
812 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 
852 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 
797 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 
797 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  34.31 
 
 
795 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
812 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
812 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 
815 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  33.3 
 
 
853 aa  369  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 
797 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 
797 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 
873 aa  363  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 
811 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  32.02 
 
 
961 aa  361  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 
833 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 
871 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 
849 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.91 
 
 
799 aa  350  9e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 
800 aa  348  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  33.12 
 
 
797 aa  348  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 
823 aa  347  5e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  33 
 
 
811 aa  346  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  31.71 
 
 
870 aa  341  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 
847 aa  330  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 
817 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 
918 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 
851 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 
857 aa  321  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 
867 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  32.48 
 
 
848 aa  320  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 
853 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 
924 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.29 
 
 
874 aa  317  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 
887 aa  315  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 
948 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 
850 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.82 
 
 
867 aa  312  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
868 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 
870 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 
947 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 
987 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
869 aa  293  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.01 
 
 
864 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 
879 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 
924 aa  282  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.21 
 
 
856 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.11 
 
 
1015 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 
948 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 
867 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 
861 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 
858 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 
872 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 
877 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
843 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 
867 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 
867 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
867 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 
867 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1132  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 
930 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746055  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2047  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
803 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.54 
 
 
880 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  38.33 
 
 
981 aa  98.6  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 
856 aa  98.6  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 
871 aa  97.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  40.12 
 
 
836 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 
852 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 
872 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 
843 aa  95.5  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 
855 aa  95.9  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>