181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7303 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  100 
 
 
474 aa  978    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31.13 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  32.39 
 
 
468 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  31.43 
 
 
482 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.04 
 
 
503 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  31.28 
 
 
461 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.83 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.51 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.27 
 
 
446 aa  143  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  28.23 
 
 
463 aa  143  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.6 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  26.64 
 
 
481 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  30.79 
 
 
451 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  30.63 
 
 
500 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  29.93 
 
 
472 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  28.63 
 
 
451 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.32 
 
 
503 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.32 
 
 
503 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  29.55 
 
 
456 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 
468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.93 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  31.02 
 
 
454 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.37 
 
 
456 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  32.63 
 
 
458 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
458 aa  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  24.89 
 
 
449 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  27.85 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.68 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.97 
 
 
465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.98 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  28.81 
 
 
467 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.09 
 
 
450 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  31.77 
 
 
455 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  30.85 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.69 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  28.4 
 
 
461 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  27.08 
 
 
450 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.33 
 
 
453 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.74 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  26.79 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.38 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  27.64 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.19 
 
 
451 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  30.92 
 
 
463 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  30.92 
 
 
464 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 
482 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  29.02 
 
 
485 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  29.86 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  27.87 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.68 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  31.56 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  29.46 
 
 
465 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  35.55 
 
 
447 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  28.01 
 
 
488 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  29.54 
 
 
454 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  27.59 
 
 
460 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.51 
 
 
457 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  23.22 
 
 
469 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  29.53 
 
 
453 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7426  2-methylcitrate dehydratase family protein  27.41 
 
 
493 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  27.29 
 
 
457 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  32.61 
 
 
458 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  28.95 
 
 
441 aa  107  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  28.53 
 
 
453 aa  106  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  28.69 
 
 
462 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  27.81 
 
 
462 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  29.07 
 
 
459 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  30.13 
 
 
462 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  27.2 
 
 
453 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  29.02 
 
 
443 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  27.86 
 
 
455 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 
501 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.9 
 
 
454 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  27.3 
 
 
443 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  26.14 
 
 
470 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  27.66 
 
 
487 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  27.46 
 
 
465 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  32.05 
 
 
458 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  28.24 
 
 
457 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  29.82 
 
 
486 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  30.32 
 
 
442 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  26.58 
 
 
481 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  25.65 
 
 
483 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.59 
 
 
470 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  24.09 
 
 
449 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27 
 
 
460 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  27.76 
 
 
462 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  26.44 
 
 
454 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  25.48 
 
 
451 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  29.32 
 
 
445 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  27.52 
 
 
450 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  28.41 
 
 
494 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  26.58 
 
 
472 aa  97.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 
453 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  26.51 
 
 
491 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  26.51 
 
 
491 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  26.14 
 
 
485 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  26.51 
 
 
491 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  28.02 
 
 
449 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  26.96 
 
 
461 aa  93.6  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>