More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7295 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 
283 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 
287 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  42.91 
 
 
277 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  41.22 
 
 
286 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 
314 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
293 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
293 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 
292 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 
288 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  33.1 
 
 
294 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  30.25 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  27.82 
 
 
289 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  29.49 
 
 
308 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 
296 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 
296 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  30.85 
 
 
288 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
288 aa  122  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  30.85 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  30.85 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  30.5 
 
 
288 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  35.69 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  25.52 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
296 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
289 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 
279 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  28.67 
 
 
286 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  38.06 
 
 
156 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
293 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 
289 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  38.56 
 
 
154 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  37.25 
 
 
154 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  23.51 
 
 
287 aa  105  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.48 
 
 
289 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  37.66 
 
 
159 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  29.82 
 
 
289 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  28.12 
 
 
288 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  26.48 
 
 
289 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 
293 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 
288 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
293 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 
286 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
294 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.13 
 
 
289 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  35.9 
 
 
159 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  27.34 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  29.54 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  29.21 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  26.24 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  33.96 
 
 
160 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  37.82 
 
 
159 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  25.35 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 
325 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 
436 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
300 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2590  transcription activator, effector binding  23.6 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  20.54 
 
 
291 aa  82  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  28.63 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  25.45 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  26.33 
 
 
279 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  27.02 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  28.97 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  33.33 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  26.37 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  21.6 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  24.2 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>