More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7288 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  93.56 
 
 		 295 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7154  HpcH/HpaI aldolase  73.79 
 
 		 291 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  39.38 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  36.93 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.46 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  32.52 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  34.97 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  33.9 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  35.4 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  34.14 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  34.51 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.18 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.66 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  29.97 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  29.97 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0901  Citrate (pro-3S)-lyase  35.54 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  31.21 
 
 		 271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  30.14 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  28.37 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  29.59 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  32.16 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  30.48 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  27.99 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  31.11 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  31.83 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  31.01 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  32.87 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.21 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  29.77 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  28.14 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  28.87 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  30.14 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  28.14 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  32.67 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  30.16 
 
 		 324 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.19 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  32.76 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  30.27 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  32.4 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  30.27 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.27 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  31.56 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.27 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  30.27 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  30.27 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  27.49 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  31.12 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  29.24 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  29.17 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  29.52 
 
 		 324 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  29.52 
 
 		 324 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2235  citrate lyase, beta subunit  30.21 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  29.25 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  31.6 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.93 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  32.04 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  31.49 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  29.83 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  32.17 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  32.09 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  29.21 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1721  Citryl-CoA lyase  32.38 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  30.21 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  31.74 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  32.38 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  30.1 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  28.47 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  28.89 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  28.67 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  27.46 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  27.46 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  28.82 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  30.14 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  30.88 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  31.14 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  30.69 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  27.46 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  30.4 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  31.03 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  30.07 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  30.39 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  28.28 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  28.85 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  31.94 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  28.32 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  32.31 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  30.1 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  29.26 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  28.43 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  29.74 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  29.11 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  29.32 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  29.32 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  27.11 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  29.64 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758  putative citrate lyase beta chain (acyl lyase subunit)  31.97 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  29.18 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  27.46 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  27.65 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>