68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7197 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  100 
 
 
147 aa  293  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  89.8 
 
 
147 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  89.8 
 
 
147 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  89.8 
 
 
147 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  75.51 
 
 
147 aa  235  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  77.61 
 
 
147 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  64.71 
 
 
153 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  63.4 
 
 
153 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  62.09 
 
 
153 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  60.78 
 
 
153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  52.94 
 
 
152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  55.56 
 
 
145 aa  154  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  45.11 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  42.22 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  40 
 
 
148 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  39.55 
 
 
149 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  32.89 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  33.33 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.32 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  31.74 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  35.9 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  44.59 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  35.06 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  38.46 
 
 
126 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  32.63 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  30.36 
 
 
134 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  30.77 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  37.84 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  54.17 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  33.64 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  43.64 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  43.64 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  33 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  43.64 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  46.15 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  44 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  37.07 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  41.82 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  41.82 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  26.61 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  41.54 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  37.25 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  40.98 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  45.1 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  35.29 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  36.96 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  37.5 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  42.11 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  27.84 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  38.78 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  29.17 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  30.07 
 
 
154 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  32.39 
 
 
722 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  37.5 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  38.78 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  40.91 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  26.67 
 
 
138 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  37.7 
 
 
162 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  39.29 
 
 
143 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1037  TadE family protein  36.47 
 
 
128 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  39.22 
 
 
156 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  39.66 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  28.12 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  32.73 
 
 
154 aa  40.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  38 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  32.65 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  36.36 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  39.62 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>