More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7147 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
360 aa  725    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.62 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.03 
 
 
377 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.8 
 
 
331 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.44 
 
 
380 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.11 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.52 
 
 
363 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.23 
 
 
326 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.7 
 
 
369 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.36 
 
 
367 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.44 
 
 
338 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  33.71 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.29 
 
 
378 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  31.92 
 
 
363 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.4 
 
 
376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.82 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.97 
 
 
373 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.97 
 
 
373 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.79 
 
 
373 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.29 
 
 
315 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.08 
 
 
313 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.03 
 
 
364 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  30.03 
 
 
364 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.07 
 
 
373 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.79 
 
 
373 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.69 
 
 
378 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  30.03 
 
 
364 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  30.03 
 
 
364 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  30.51 
 
 
363 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.03 
 
 
364 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.14 
 
 
373 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  30.03 
 
 
365 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.55 
 
 
355 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.55 
 
 
355 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.52 
 
 
373 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.26 
 
 
316 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.27 
 
 
374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.27 
 
 
374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  35.26 
 
 
346 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.9 
 
 
376 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  35.55 
 
 
376 aa  156  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.29 
 
 
374 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.83 
 
 
377 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 
350 aa  155  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.04 
 
 
376 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  29.48 
 
 
364 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.49 
 
 
383 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.53 
 
 
316 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.73 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.53 
 
 
377 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.93 
 
 
378 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.03 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.51 
 
 
376 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.23 
 
 
325 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.9 
 
 
371 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.51 
 
 
376 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.51 
 
 
376 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  32.06 
 
 
321 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.48 
 
 
320 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.65 
 
 
346 aa  149  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.83 
 
 
372 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.45 
 
 
316 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.86 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  31.27 
 
 
347 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.94 
 
 
313 aa  146  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.03 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.11 
 
 
319 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  32.03 
 
 
355 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.51 
 
 
356 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.43 
 
 
492 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.16 
 
 
314 aa  142  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.99 
 
 
378 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.07 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.07 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.14 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.98 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  31.28 
 
 
350 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.09 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.95 
 
 
323 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  31.56 
 
 
321 aa  138  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.05 
 
 
313 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  31.15 
 
 
383 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.03 
 
 
375 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
355 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  34.22 
 
 
378 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  30.84 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.92 
 
 
325 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.62 
 
 
324 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.67 
 
 
324 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.32 
 
 
354 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.67 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.14 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  33.24 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.13 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  33.87 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.62 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.46 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.95 
 
 
345 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.52 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>