More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6998 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  49.09 
 
 		 857 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  49.09 
 
 		 857 aa  685    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  48.83 
 
 		 824 aa  739    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  47.25 
 
 		 812 aa  715    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  47.87 
 
 		 865 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  60.74 
 
 		 940 aa  1088    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.3 
 
 		 859 aa  715    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  47.14 
 
 		 817 aa  764    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.44 
 
 		 811 aa  768    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  45.55 
 
 		 861 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.67 
 
 		 874 aa  710    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  48.55 
 
 		 854 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.44 
 
 		 811 aa  768    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  49.44 
 
 		 811 aa  768    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  49.44 
 
 		 811 aa  767    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  47.95 
 
 		 858 aa  700    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  48.07 
 
 		 858 aa  701    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  46.78 
 
 		 830 aa  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  45 
 
 		 855 aa  724    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  58.79 
 
 		 942 aa  1044    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  49.62 
 
 		 891 aa  728    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  48.89 
 
 		 823 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  45.97 
 
 		 872 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  47.23 
 
 		 814 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  100 
 
 		 949 aa  1920    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  45.36 
 
 		 862 aa  722    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  46.84 
 
 		 843 aa  737    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  46.67 
 
 		 862 aa  718    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  46.67 
 
 		 846 aa  739    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  48.63 
 
 		 864 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  59.69 
 
 		 949 aa  1095    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.44 
 
 		 811 aa  768    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  45.99 
 
 		 842 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  49.32 
 
 		 824 aa  743    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  45.94 
 
 		 883 aa  718    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  50.83 
 
 		 869 aa  704    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  46.74 
 
 		 870 aa  687    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  48.61 
 
 		 840 aa  732    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  47.14 
 
 		 870 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  49.14 
 
 		 834 aa  727    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  50.32 
 
 		 879 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  45.5 
 
 		 865 aa  702    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0367  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.24 
 
 		 857 aa  691    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  48.71 
 
 		 879 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  59.69 
 
 		 949 aa  1095    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  50.7 
 
 		 861 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  57.57 
 
 		 961 aa  1082    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  48.54 
 
 		 879 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  49.56 
 
 		 878 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  49.94 
 
 		 861 aa  730    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  47.08 
 
 		 862 aa  709    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  48.37 
 
 		 859 aa  697    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  96.52 
 
 		 946 aa  1743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  45.85 
 
 		 848 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  47.41 
 
 		 847 aa  723    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  50.13 
 
 		 837 aa  699    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  53.07 
 
 		 886 aa  831    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  46.88 
 
 		 834 aa  733    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  46.49 
 
 		 891 aa  727    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  46.21 
 
 		 814 aa  721    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  45.97 
 
 		 814 aa  714    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  44.52 
 
 		 870 aa  710    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  48.82 
 
 		 825 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  47.87 
 
 		 825 aa  747    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  50.71 
 
 		 864 aa  699    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  47.3 
 
 		 828 aa  720    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  92.56 
 
 		 953 aa  1699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  71 
 
 		 850 aa  1160    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  47.98 
 
 		 854 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  47.82 
 
 		 830 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  45.97 
 
 		 889 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  46.93 
 
 		 857 aa  688    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  96.52 
 
 		 946 aa  1743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  47.14 
 
 		 839 aa  726    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  43.08 
 
 		 854 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  45.96 
 
 		 875 aa  688    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4012  ATPase  66.97 
 
 		 953 aa  1144    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  45.84 
 
 		 861 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  45.85 
 
 		 848 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  47.41 
 
 		 847 aa  723    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  48.41 
 
 		 847 aa  734    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  46.43 
 
 		 859 aa  695    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  61.05 
 
 		 949 aa  1095    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  46.61 
 
 		 842 aa  733    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  45.89 
 
 		 843 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  45 
 
 		 855 aa  725    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  45.64 
 
 		 859 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  45.7 
 
 		 863 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1549  putative ATP-dependent protease (heat shock protein)  51.57 
 
 		 867 aa  688    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  48.53 
 
 		 818 aa  781    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0467  ATPase  45.85 
 
 		 848 aa  693    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  47.72 
 
 		 847 aa  736    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  46.67 
 
 		 841 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  49.69 
 
 		 812 aa  778    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0246  ATPase  47.09 
 
 		 848 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  48.04 
 
 		 847 aa  713    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  45.33 
 
 		 840 aa  689    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0121  ATPase  46.76 
 
 		 863 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  49.75 
 
 		 848 aa  743    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  48.6 
 
 		 844 aa  721    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>