32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6980 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  206  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  91.59 
 
 
107 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1213  hypothetical protein  90.57 
 
 
107 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  51.81 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  55.13 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  55.13 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  55.13 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  57.14 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  57.14 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  57.14 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  47.56 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  50 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  47.44 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  44.58 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  45.12 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  43.75 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  43.37 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  40.24 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  49.02 
 
 
73 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  49.02 
 
 
73 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  45 
 
 
73 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  49.02 
 
 
73 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  49.02 
 
 
73 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  49.02 
 
 
73 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  49.02 
 
 
73 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3148  RebB protein  39.74 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2096  RebB protein  42.68 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.887295  normal  0.0193954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3004  RebB protein  47.14 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6983  hypothetical protein  52 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1216  hypothetical protein  51.92 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0794  hypothetical protein  43.48 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1243  hypothetical protein  51.92 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>