32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6978 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  217  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  96.3 
 
 
110 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  95.37 
 
 
111 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  80.77 
 
 
128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  79.81 
 
 
122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  80.77 
 
 
122 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  46.46 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  44.44 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  58.21 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  53.57 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  54.93 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1213  hypothetical protein  53.52 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  47.5 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  45.98 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  47.5 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  46.34 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  43.75 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2096  RebB protein  43.75 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.887295  normal  0.0193954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  42.5 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  50 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  50 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  50 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  50 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  50 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  50 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  50 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6983  hypothetical protein  55.1 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1216  hypothetical protein  49.12 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3004  RebB protein  52.46 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1243  hypothetical protein  49.12 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3148  RebB protein  39.71 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0794  hypothetical protein  39.73 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>