64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6747 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6747  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405186  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 
349 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  46.55 
 
 
371 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  47.41 
 
 
357 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  46.09 
 
 
365 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  45.76 
 
 
400 aa  94.7  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  48.33 
 
 
365 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 
352 aa  91.3  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  48.31 
 
 
363 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  36.97 
 
 
343 aa  72  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  44.68 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  41.9 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  40.52 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 
359 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 
354 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  42.27 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  43.3 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  42.55 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  36.94 
 
 
348 aa  64.7  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
358 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
359 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  37.82 
 
 
344 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  40 
 
 
359 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 
335 aa  62  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
354 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  40.24 
 
 
356 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 
359 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  42.2 
 
 
383 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  41.96 
 
 
331 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  42.2 
 
 
326 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  35.9 
 
 
349 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  39.74 
 
 
354 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  42.2 
 
 
359 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  42.2 
 
 
359 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  38.95 
 
 
359 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  42.2 
 
 
359 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  42.2 
 
 
359 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  38.26 
 
 
384 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  42.2 
 
 
359 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 
340 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  34.11 
 
 
352 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
359 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  39.58 
 
 
342 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  40.82 
 
 
359 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.38 
 
 
357 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
359 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  43.86 
 
 
354 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
357 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  37.39 
 
 
358 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  36.04 
 
 
366 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  39.8 
 
 
359 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  33.01 
 
 
354 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  35.9 
 
 
359 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 
357 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  43.18 
 
 
362 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 
321 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  32.08 
 
 
329 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
369 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
350 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  35.29 
 
 
335 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>