More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6734 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
394 aa  779    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  74.68 
 
 
430 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  74.68 
 
 
430 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  75.95 
 
 
385 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  75.68 
 
 
385 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  75.95 
 
 
385 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  75.41 
 
 
384 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  74.43 
 
 
411 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  75.14 
 
 
384 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  75.14 
 
 
384 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  75.14 
 
 
384 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  72.7 
 
 
385 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  72.51 
 
 
385 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  72.75 
 
 
386 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  72.16 
 
 
385 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  71.32 
 
 
523 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  63.17 
 
 
387 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  62.6 
 
 
386 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  63.61 
 
 
386 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  63.61 
 
 
386 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  63.29 
 
 
386 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  65.32 
 
 
386 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  63.29 
 
 
386 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  63.29 
 
 
386 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  64.67 
 
 
388 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  61.4 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  60.9 
 
 
393 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  55.61 
 
 
390 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  58.48 
 
 
390 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  58.69 
 
 
430 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  58.94 
 
 
430 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  58.69 
 
 
430 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  58.69 
 
 
430 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  58.73 
 
 
390 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  56.7 
 
 
386 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  58.69 
 
 
430 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  58.69 
 
 
430 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  58.69 
 
 
390 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  58.99 
 
 
390 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  60.32 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  59.52 
 
 
390 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  58.98 
 
 
390 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  59.52 
 
 
390 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  56.59 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  56.56 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  55.67 
 
 
404 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  56.64 
 
 
386 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  57.84 
 
 
386 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  57.84 
 
 
386 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  54.73 
 
 
376 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  51.28 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  51.28 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  51.03 
 
 
376 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  50.25 
 
 
389 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  45.41 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  45.66 
 
 
397 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  45.15 
 
 
421 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  45.15 
 
 
421 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  44.12 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  44.12 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  44.12 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  44.12 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.87 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.62 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.9 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.39 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  44.12 
 
 
399 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  44.47 
 
 
391 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.56 
 
 
397 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.69 
 
 
389 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  44.5 
 
 
445 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.95 
 
 
436 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.45 
 
 
383 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.44 
 
 
436 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.44 
 
 
386 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.44 
 
 
386 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.44 
 
 
386 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.44 
 
 
386 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.44 
 
 
386 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.2 
 
 
383 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.19 
 
 
386 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.2 
 
 
383 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.2 
 
 
383 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  45.95 
 
 
389 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.7 
 
 
389 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.61 
 
 
389 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  43.05 
 
 
378 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  44.09 
 
 
391 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  44.3 
 
 
402 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  42.75 
 
 
400 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  43.48 
 
 
393 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  42.15 
 
 
395 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  42.15 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  42.15 
 
 
395 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.79 
 
 
400 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  40.84 
 
 
380 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  43.87 
 
 
381 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  42.86 
 
 
403 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  42.15 
 
 
395 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  44.51 
 
 
398 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>