More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6677 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  100 
 
 		 470 aa  963    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  59.51 
 
 		 460 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  32.45 
 
 		 477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  36.07 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  31.04 
 
 		 476 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.89 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  34.03 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  32.3 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 489 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 		 439 aa  163  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 450 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 447 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  23.09 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  32.04 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 499 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  27.73 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  28.95 
 
 		 275 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 429 aa  96.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 434 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 471 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 400 aa  93.6  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.71 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.78 
 
 		 394 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.78 
 
 		 394 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 450 aa  90.1  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  29.5 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.48 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  34.54 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 281 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 474 aa  87  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  26.65 
 
 		 481 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.5 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  29.04 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  33.73 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  26.19 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  22.09 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  22.96 
 
 		 728 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  27.49 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>