279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6654 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  87.32 
 
 
425 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
426 aa  869    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  98.12 
 
 
426 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  88.97 
 
 
426 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  88.97 
 
 
426 aa  777    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  93.9 
 
 
426 aa  820    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  97.89 
 
 
426 aa  853    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  96.71 
 
 
426 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  96.24 
 
 
426 aa  841    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  97.89 
 
 
426 aa  853    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  69.06 
 
 
411 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  69.95 
 
 
418 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  69.34 
 
 
418 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  68.72 
 
 
421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  68.72 
 
 
418 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  68.72 
 
 
418 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  68.72 
 
 
418 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  69.7 
 
 
423 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  62.53 
 
 
408 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  61.76 
 
 
420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  61.76 
 
 
420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  61.43 
 
 
428 aa  511  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  64.46 
 
 
414 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  60.34 
 
 
418 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  58.45 
 
 
426 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  58.92 
 
 
426 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  61.63 
 
 
419 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  59.61 
 
 
420 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  60.44 
 
 
418 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  59.9 
 
 
418 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  58.71 
 
 
431 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  58.87 
 
 
421 aa  484  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  58.94 
 
 
415 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  59.27 
 
 
418 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  55.72 
 
 
416 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  58.13 
 
 
418 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  56.76 
 
 
415 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  57 
 
 
415 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  60.1 
 
 
429 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  60.84 
 
 
523 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  60.84 
 
 
429 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  56.02 
 
 
416 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  56.7 
 
 
420 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  55.74 
 
 
424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  57.88 
 
 
421 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  55.04 
 
 
415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  56.19 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  57.49 
 
 
427 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  54.63 
 
 
416 aa  465  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  56.3 
 
 
412 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  55.42 
 
 
420 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  57.46 
 
 
415 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  56.56 
 
 
427 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  56.56 
 
 
427 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  56.32 
 
 
427 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  57.66 
 
 
427 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  57.63 
 
 
427 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  53.03 
 
 
419 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  57.63 
 
 
427 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  53.53 
 
 
419 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1817  allantoate amidohydrolase  53.53 
 
 
419 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  0.138716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  53.71 
 
 
416 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  52.59 
 
 
412 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  52.55 
 
 
417 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  55.09 
 
 
422 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  52.84 
 
 
413 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  54.21 
 
 
430 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  52.84 
 
 
409 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  53.83 
 
 
423 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  53.33 
 
 
427 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  53.71 
 
 
411 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  54.84 
 
 
425 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  53.33 
 
 
425 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  53.71 
 
 
423 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  53.33 
 
 
425 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3291  allantoate amidohydrolase  51.34 
 
 
417 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17984  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  53.96 
 
 
423 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  54.59 
 
 
425 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  54.59 
 
 
425 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  53.56 
 
 
416 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  54.46 
 
 
423 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  50.86 
 
 
423 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  50.36 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  53.07 
 
 
412 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  50.61 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  52.72 
 
 
424 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  53.41 
 
 
420 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  53.41 
 
 
420 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  53.41 
 
 
420 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  49.52 
 
 
431 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  53.41 
 
 
420 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  53.41 
 
 
420 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  53.41 
 
 
420 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  53.41 
 
 
420 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  49.76 
 
 
442 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  51.82 
 
 
421 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  50.86 
 
 
415 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.87 
 
 
421 aa  378  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  49.17 
 
 
479 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  49.39 
 
 
415 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>