More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3115 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
374 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  83.24 
 
 
362 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  83.24 
 
 
362 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  83.24 
 
 
362 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  78.25 
 
 
374 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  78.25 
 
 
374 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  77.98 
 
 
374 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  77.84 
 
 
376 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  77.84 
 
 
376 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  77.84 
 
 
376 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  77.98 
 
 
374 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  77.84 
 
 
376 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  81.12 
 
 
361 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  81.22 
 
 
372 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  81.22 
 
 
372 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  76.86 
 
 
363 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  65.81 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  65.81 
 
 
377 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  57.37 
 
 
372 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  52.28 
 
 
387 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.28 
 
 
383 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.03 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  51.97 
 
 
374 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  49.37 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.02 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.02 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.02 
 
 
379 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.02 
 
 
379 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.77 
 
 
379 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.53 
 
 
379 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.15 
 
 
381 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.37 
 
 
381 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  48.98 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  48.98 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  48.98 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  48.98 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  48.98 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  48.98 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  48.98 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  48.73 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  51.41 
 
 
380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.15 
 
 
384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  51.41 
 
 
380 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.24 
 
 
383 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  47.61 
 
 
383 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 
390 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  49.1 
 
 
379 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  48.31 
 
 
383 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  46.95 
 
 
384 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  50.14 
 
 
383 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.46 
 
 
384 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.46 
 
 
384 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.46 
 
 
384 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  47.56 
 
 
391 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  46.35 
 
 
381 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  47.84 
 
 
380 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  48.09 
 
 
380 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  49.45 
 
 
409 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  48.85 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.95 
 
 
384 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  48.6 
 
 
380 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  46.45 
 
 
384 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  45.48 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  45.48 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  48.24 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  45.23 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  45.92 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  46.95 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  47.84 
 
 
380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  47.46 
 
 
380 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  46.65 
 
 
376 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  45.15 
 
 
383 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  44.97 
 
 
386 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  45.66 
 
 
384 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  45.66 
 
 
384 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  47.21 
 
 
379 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  46.41 
 
 
375 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  46.58 
 
 
386 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  44.42 
 
 
394 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  45.41 
 
 
384 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  46.13 
 
 
375 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  47.34 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  45.98 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  46.15 
 
 
375 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  46.15 
 
 
375 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.03 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  46.54 
 
 
386 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  47.36 
 
 
383 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.92 
 
 
394 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  42.42 
 
 
383 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  46.21 
 
 
382 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  44.81 
 
 
383 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  45.32 
 
 
384 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>