111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3111 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  100 
 
 
168 aa  328  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  62 
 
 
169 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  60.67 
 
 
169 aa  175  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  61.15 
 
 
168 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  63.41 
 
 
169 aa  163  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  64.23 
 
 
1210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  64.23 
 
 
169 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  64.23 
 
 
169 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  64.23 
 
 
169 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  64.23 
 
 
169 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  64.23 
 
 
169 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  64.23 
 
 
169 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  51.5 
 
 
170 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  53.69 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  53.69 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  53.69 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  52.32 
 
 
170 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  53.85 
 
 
170 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  53.85 
 
 
170 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  51.43 
 
 
169 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  48.3 
 
 
169 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  47.1 
 
 
169 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  45.51 
 
 
168 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  45.83 
 
 
168 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  46.43 
 
 
168 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  45.83 
 
 
168 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  41.18 
 
 
161 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  41.18 
 
 
159 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  40.3 
 
 
161 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  40.91 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  37.93 
 
 
159 aa  94  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  34.9 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  38.53 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  33.12 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  34.64 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  33.78 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  33.56 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  33.55 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  34.81 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  33.1 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  33.1 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  31.08 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  30.5 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  31.58 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  32.14 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  29.79 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  34.62 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  36.44 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  29.41 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  36.44 
 
 
176 aa  57.4  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  31.47 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  29.73 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  29.05 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  31.91 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  34.87 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  34.87 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  34.21 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  34.87 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  34.87 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  32.33 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  34.81 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  34.97 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  33.1 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  31.47 
 
 
176 aa  54.3  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  30.95 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  32.88 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  37.7 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  31.82 
 
 
177 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  32.12 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  28.47 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  32 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  32 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  34.78 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  32 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  32 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  32 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  32 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  32 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  32 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  32.65 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  28 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  31.76 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  30 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  31.47 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  28.1 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  33.83 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  26.49 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  27.42 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  27.15 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  30 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  35.53 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  31.82 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2610  disulphide bond formation protein DsbB  30 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  30.14 
 
 
175 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  30.14 
 
 
175 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  33.93 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  28.93 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  28.08 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  30.53 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>