60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3106 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3106  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3199  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  40.93 
 
 
394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0555142  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1346  aromatic hydrocarbon degradation protein  32.67 
 
 
391 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000227507  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0576  putative long-chain fatty acid transport protein  30.79 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00218092  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.12 
 
 
463 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2542  outer membrane protein, OMPP1/FadL/TodX family  28.67 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0142574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2170  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.67 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000480388  decreased coverage  0.000000000685095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3896  hypothetical protein  26.44 
 
 
442 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3997  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.44 
 
 
410 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4111  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.84 
 
 
418 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129657  normal  0.252995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4038  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.2 
 
 
410 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.813812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2202  SalD  25.4 
 
 
430 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.476706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2203  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.71 
 
 
422 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.92236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2180  long-chain fatty acid ABC transporter  29.2 
 
 
381 aa  97.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000739013  hitchhiker  0.00000487757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0645  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  25.57 
 
 
438 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0456  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.6 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000969908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1799  long-chain fatty acid transport protein  25.75 
 
 
455 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.471886  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0747  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.56 
 
 
435 aa  86.3  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1535  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.66 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.745918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3558  Outer membrane protein (CymD)  25.68 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239673  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2776  putative transporter protein  26.26 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356239  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2053  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.93 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000452049  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4639  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.47 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166851  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5672  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.55 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224746  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3563  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.47 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.361655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0428  OMPP1/FadL/TodX family toluene transport protein  25.06 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2498  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.86 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.953303  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0449  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.77 
 
 
458 aa  67  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0843  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.96 
 
 
472 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.66 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2901  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.06 
 
 
460 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875359  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.71 
 
 
412 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2883  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.68 
 
 
453 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0024  toluene transport protein, putative  23.44 
 
 
461 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.137484  normal  0.133309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0032  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.83 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2330  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.21 
 
 
475 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.1 
 
 
424 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0907  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.72 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000931505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  22.82 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.86 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.31 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1772  outer membrane protein transport protein (ompp1/fadl/todx)  22.11 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000672167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3814  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.79 
 
 
464 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0090168  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.41 
 
 
450 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.86 
 
 
453 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0246  membrane protein  23.51 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1467  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.38 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1488  outer membrane protein transport protein (OMPP1/FadL/TodX)  23.5 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000022561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0053  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.74 
 
 
471 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  24.47 
 
 
412 aa  46.6  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2534  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  18.98 
 
 
529 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0440745  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.57 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0134  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.25 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.73 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6026  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.92 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.32 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3793  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.32 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0821  long-chain fatty acid transport like protein  21.72 
 
 
457 aa  43.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2178  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.28 
 
 
440 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000636439  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04350  outer membrane protein P1, putative  21.51 
 
 
415 aa  43.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0256286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>