More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3072 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
341 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  74.41 
 
 
351 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  74.41 
 
 
351 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  74.26 
 
 
340 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  76.16 
 
 
340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  63.83 
 
 
334 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4804  MerR family transcriptional regulator  55.85 
 
 
341 aa  348  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 
183 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
138 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  35.07 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
139 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30.83 
 
 
130 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 
268 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30 
 
 
130 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
166 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
166 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
166 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
166 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
166 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
166 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1895  transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 
260 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  unclonable  1.71834e-16 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
140 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 
139 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 
124 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
137 aa  59.3  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
250 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
250 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  41.57 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 
254 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
257 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  42.55 
 
 
96 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 
117 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
179 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
141 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
138 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 
138 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  48.44 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  35.71 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.45 
 
 
129 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  41.57 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
139 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 
142 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  35.64 
 
 
254 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35.45 
 
 
129 aa  57  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 
254 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  39.47 
 
 
262 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
252 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 
137 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
136 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
152 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
153 aa  56.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 
295 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
130 aa  56.2  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  30.77 
 
 
132 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
161 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
127 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
127 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
260 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  34.82 
 
 
142 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  36.63 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
158 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
136 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
138 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
146 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 
135 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
147 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 
159 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>