90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3039 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 
224 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  93.3 
 
 
224 aa  430  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  91.52 
 
 
224 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  91.52 
 
 
224 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  91.07 
 
 
224 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  90.62 
 
 
236 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  83.48 
 
 
236 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  73.66 
 
 
224 aa  326  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  73.66 
 
 
224 aa  326  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  61.06 
 
 
225 aa  251  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 
225 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
224 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  43.72 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  43.72 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  45.91 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 
224 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.23 
 
 
224 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.37 
 
 
222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  40.53 
 
 
224 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  40.27 
 
 
224 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  42.48 
 
 
222 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  41.7 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
271 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 
227 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  37.45 
 
 
236 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  36.12 
 
 
218 aa  124  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
244 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  36.44 
 
 
236 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  33.19 
 
 
236 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  34.04 
 
 
236 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
232 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
230 aa  114  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 
234 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  32.34 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
235 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  32.92 
 
 
238 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
234 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  31.88 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  31.88 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  31.88 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  31.88 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  31.88 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  31.88 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  31.88 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  30.13 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  25.42 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  25.48 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.23 
 
 
209 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  30 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  35.16 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
411 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  25.22 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  27.12 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  23.58 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
157 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  34.07 
 
 
247 aa  45.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  34.04 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  34.07 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
240 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  31.18 
 
 
228 aa  45.1  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  32.97 
 
 
207 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  29.51 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.1 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  32.26 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  25.53 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  24.55 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.41 
 
 
158 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.78 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  26.88 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  28.72 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  29.03 
 
 
248 aa  42  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.71 
 
 
444 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 
248 aa  42  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
253 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>