More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3021 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  476  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  74.35 
 
 		 241 aa  362  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  73.5 
 
 		 241 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 241 aa  358  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  72.77 
 
 		 242 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  70.26 
 
 		 241 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  54.55 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  52.05 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  52.45 
 
 		 263 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  53.3 
 
 		 263 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  44.75 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  44.98 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  44.1 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  44.54 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 275 aa  180  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  43.96 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  47.34 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  46.7 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 295 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2445  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.247601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  36.06 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 211 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.2 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  32.32 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 212 aa  99  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>